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Enregistrement W3157600424 · doi:10.1210/jendso/bvab048.1046

The Use of Genetic Testing Panels for Dyslipidemia: A Quality Improvement Project at the McGill University Health Centre

2021· article· en· W3157600424 sur OpenAlexaffabout
Melissa‐Rosina Pasqua, Aurélie Paré, David Blank, Brian M. Gilfix

Notice bibliographique

RevueJournal of the Endocrine Society · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenetic testingDyslipidemiaMedicineSpecialtyFamily medicineTest (biology)Internal medicineBiologyObesity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Genetic testing panels are used to identify the most common genetic causes of dyslipidemia, and the results of these panels can guide treatment and management. The objective of this quality improvement project was to assess the appropriateness of genetic testing panels requested by the McGill University Health Centre (MUHC). Methods: Genetic testing panels sent for analysis from January 2018 to December 2019 were identified. Ordering physician specialty, patient personal and family medical history, lipid panel results, and genetic testing results were collected. Then, validated Familial Hyperlipidemia (FH) scores (Simon-Broome Registry Criteria, Dutch Lipid Clinic Network Criteria, FH Canada criteria) were calculated for patients who underwent genetic testing for suspected FH. Results: There were 36 genetic test panels sent out for analysis during the study period, of which 24 were accessible for data analysis. Pathogenic mutations were identified in 7/24 (29%) of the analyzed panels. The 19/24 (79%) of the panels were requested by lipid specialists, and all of the panels positive for pathogenic mutations were requested by lipid specialists. Interestingly, 23/24 (94%) of the patients met the Canadian criteria for at least considering genetic testing, suggesting that most panels were appropriately requested. Only 3/24 (12%) of patients had insufficient criteria for FH by the Simon-Broome criteria, but all of these carried pathogenic mutations. Conclusion: These results suggest that at the MUHC, using the Canadian criteria identifies a greater number of patients for genetic testing and for appropriate diagnosis and treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,577
Score d'incertitude au seuil0,534

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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