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Enregistrement W3157791544 · doi:10.1126/scitranslmed.abd9898

Integrated trajectories of the maternal metabolome, proteome, and immunome predict labor onset

2021· article· en· W3157791544 sur OpenAlexaff
Ina A. Stelzer, Mohammad Sajjad Ghaemi, Xiaoyuan Han, Kazuo Ando, Julien Hédou, Dorien Feyaerts, Laura S. Peterson, Kristen K. Rumer, Eileen S. Tsai, Edward A. Ganio, Dyani Gaudillière, Amy S. Tsai, Benjamin Choisy, L. Gaigne, Franck Verdonk, Danielle R. Jacobsen, Sonia Gavasso, Gavin M. Traber, Mathew Ellenberger, Natalie Stanley, Martin Becker, Anthony Culos, Ramin Fallahzadeh, Ronald J. Wong, Gary L. Darmstadt, Maurice L. Druzin, Virginia D. Winn, Ronald S. Gibbs, Xuefeng B. Ling, Karl G. Sylvester, Brendan Carvalho, M Snyder, Gary M. Shaw, David K. Stevenson, Kévin Contrepois, Martin S. Angst, Nima Aghaeepour, Brice Gaudillière

Notice bibliographique

RevueScience Translational Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePregnancy and preeclampsia studies
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingStanford Maternal and Child Health Research InstituteDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Heart, Lung, and Blood InstituteEvergreen State College FoundationNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesAmerican Heart AssociationNational Institutes of HealthMarch of Dimes FoundationBill and Melinda Gates FoundationDoris Duke Charitable Foundation
Mots-clésMetabolomeProteomePregnancyPeripheral bloodBiologyMedicineComputational biologyPhysiologyBioinformaticsInternal medicineMetabolomicsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

= 10, independent test set]. Coordinated alterations in maternal metabolome, proteome, and immunome marked a molecular shift from pregnancy maintenance to prelabor biology 2 to 4 weeks before delivery. A surge in steroid hormone metabolites and interleukin-1 receptor type 4 that preceded labor coincided with a switch from immune activation to regulation of inflammatory responses. Our study lays the groundwork for developing blood-based methods for predicting the day of labor, anchored in mechanisms shared in preterm and term pregnancies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations143
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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