MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3158079048

Metabolomic Profiling of Biomarkers Indicative of Ancestral and Lifetime Adversity in a Two-Hit Stress Model

2018· article· en· W3158079048 sur OpenAlexaff
Prachi Sanghavi, Joshua P. Heynen, Keiko J.K. McCreary, Tony Montina, Gerlinde A. S. Metz

Notice bibliographique

RevueURSCA Proceedings · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetabolomeBiologyOffspringLineage (genetic)Transgenerational epigeneticsStressorHeritabilityNormalization (sociology)PhysiologyStress (linguistics)MetabolomicsGeneticsEvolutionary biologyMedicinePregnancyBioinformaticsGeneNeuroscience
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Chronic prenatal maternal stress (PNMS) can have adverse effects on the developing fetus and lifetime health. The effects depend on the number of stressors individuals are exposed to. Over-activation of the mother’s stress response also potentially triggers epigenetic marks that can be transmitted to several generations of offspring. To date, very little research has focused on how exposure to ancestral PNMS affects an individual’s response to both chronic and acute stress throughout their lifetime. The purpose of this study was to investigate if exposure to ancestral PNMS puts an individual at an evolutionary advantage or disadvantage with respect to their altered stress response. This study utilized a rat model of ancestral PNMS to explore the response of the metabolome to both acute and chronic stress. Methods: Forty-eight male rats from the third filial generation were derived from three different lineages: (1) a transgenerational PNMS lineage where only the F0 mother was exposed to stress; (2) a multigenerational PNMS lineage where the mother from each generation was exposed to stress; and (3) a control lineage where there was no experimental stress exposure. Each of these groups were split in two; an acute stress group and a chronic stress group. Plasma was collected from each animal, processed to extract the water-soluble metabolites, added to NMR buffer, and pipetted into NMR tubes. NMR spectra were acquired and the data underwent a data reduction step (binning), normalization, scaling, and both univariate and multivariate statistical testing. These tests identified spectral peaks from metabolites that had been significantly altered across comparison groups. Chemometric software was utilized to determine the identity of altered metabolites and pathway topology analysis was performed. Results: Multivariate and univariate statistical tests indicated that exposure to chronic stress in ancestrally stressed rats creates significant alteration in the metabolomic profile when compared to control animals. No differences were observed in the case of acute stress. Conclusions: Our results support the hypothesis that ancestral and lifetime stress cumulatively affect the metabolome. A subset of metabolites can potentially act as biomarkers of stress during pregnancy. This procedure may aid in the development of new predictive and diagnostic strategies in precision medicine approaches. *Indicates presenter

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueURSCA ProceedingsMême sujetBirth, Development, and HealthTravaux en français237 207