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Enregistrement W3158107084 · doi:10.3390/ani11051257

Classical, Molecular, and Genomic Cytogenetics of the Pig, a Clinical Perspective

2021· review· en· W3158107084 sur OpenAlexaff
Brendan Donaldson, D.A.F. Villagómez, W.A. King

Notice bibliographique

RevueAnimals · 2021
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCytogeneticsMolecular cytogeneticsBiologyComparative genomic hybridizationKaryotypeGeneticsFluorescence in situ hybridizationBacterial artificial chromosomeChromosomal translocationChromosomeComputational biologyGenomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

) are known to be prone to reciprocal chromosome translocations and other balanced chromosome rearrangements with concomitant fertility impairment of carriers. In response to the remarkable prevalence of chromosome rearrangements in swine herds, clinical cytogenetics laboratories have been established in several countries in order to screen young boars for chromosome rearrangements prior to service. At present, clinical cytogenetics laboratories typically apply classical cytogenetics techniques such as giemsa-trypsin (GTG)-banding to produce high-quality karyotypes and reveal large-scale chromosome ectopic exchanges. Further refinements to clinical cytogenetics practices have led to the implementation of molecular cytogenetics techniques such as fluorescent in-situ hybridization (FISH), allowing for rearrangements to be visualized and breakpoints refined using fluorescently labelled painting probes. The next-generation of clinical cytogenetics include the implementation of DNA microarrays, and next-generation sequencing (NGS) technologies such as DNA sequencing to better explore tentative genome architecture changes. The implementation of these cytogenomics techniques allow the genomes of rearrangement carriers to be deciphered at the highest resolution, allowing rearrangements to be detected; breakpoints to be delineated; and, most importantly, potential gene implications of those chromosome rearrangements to be interrogated. Clinical cytogenetics has become an integral tool in the livestock industry, identifying rearrangements and allowing breeders to make informed breeding decisions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil0,205

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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