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Enregistrement W3158123652 · doi:10.1139/cjm-2020-0576

Molecular analyses of the diversity and function of the family 1 β-glucosidase-producing microbial community in compost

2021· article· en· W3158123652 sur OpenAlexvenueno aff
Xinyue Zhang, Erlie Su, Shanshan Li, Xiehui Chen, Zhihua Fan, Meiting Liu, Bo Ma, Hongtao Li

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueComposting and Vermicomposting Techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésActinobacteriaFirmicutesProteobacteriaBiologyCompostGeneMicrobial population biologyGeneticsMicrobiologyFood scienceBotanyBacteriaEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The diversity and transcription efficiency of GH1 family β-glucosidase genes were investigated in natural and inoculated composts using a DNA clone library and real-time qPCR. Compositional differences were observed in the functional communities between the two composting processes. Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes, and Chloroflexi were the dominant phyla. Twenty representative β-glucosidase genes were quantitatively analyzed from the DNA and RNA pools. Principal component analysis and Pearson’s correlation analysis showed that cellulose degradation is correlated with the composition and succession of functional microbial communities, and this correlation was mainly observed in Proteobacteria and Actinobacteria. Compared with inoculated compost, the functional microbial communities in natural compost with a low diversity index exhibited a weak buffering capacity for function in response to environmental changes. This may explain the consistency and dysfunction of cellulose degradation and transcriptional regulation by dominant β-glucosidase genes. Except for the β-glucosidase genes encoding constitutive enzymes, individual β-glucosidase genes responded to environmental changes more drastically than the group β-glucosidase genes. The correlation results suggested that β-glucosidase genes belonging to Micrococcales play an important role in the regulation of intracellular β-glucosidase. These results indicated that the responses of functional microorganisms were different during both composting processes and were reflected at both the individual and group levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,517
Score d'incertitude au seuil0,975

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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