MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3158741652 · doi:10.1016/j.isci.2021.102477

Experimental and natural evidence of SARS-CoV-2-infection-induced activation of type I interferon responses

2021· article· en· W3158741652 sur OpenAlexafffund
Arinjay Banerjee, Nader El-Sayes, Patrick Budylowski, Rajesh Abraham Jacob, Daniel Richard, Hassaan Maan, Jennifer A. Aguiar, Wael L. L. Demian, Kaushal Baid, Michael R. D’Agostino, Jann C. Ang, Tetyana Murdza, Benjamin J.-M. Tremblay, Sam Afkhami, Mehran Karimzadeh, Aaron T. Irving, Lily Yip, Mario Ostrowski, Jeremy A. Hirota, Robert Kozak, Terence D. Capellini, Matthew S. Miller, Bo Wang, Samira Mubareka, Allison McGeer, Andrew G. McArthur, Andrew C. Doxey, Karen Mossman

Notice bibliographique

RevueiScience · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensMount Sinai HospitalPublic Health OntarioUniversity of British ColumbiaSt. Michael's HospitalVector InstituteUniversity of TorontoUniversity Health NetworkSunnybrook Health Science CentreUniversity of WaterlooMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchZhejiang UniversityNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsMcMaster University
Mots-clésInterferonBiologyIn vitroVirologyImmunologyViral replicationSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)VirusMedicineGeneticsInfectious disease (medical specialty)DiseaseInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Type I interferons (IFNs) are our first line of defense against virus infection. Recent studies have suggested the ability of SARS-CoV-2 proteins to inhibit IFN responses. Emerging data also suggest that timing and extent of IFN production is associated with manifestation of COVID-19 severity. In spite of progress in understanding how SARS-CoV-2 activates antiviral responses, mechanistic studies into wild-type SARS-CoV-2-mediated induction and inhibition of human type I IFN responses are scarce. Here we demonstrate that SARS-CoV-2 infection induces a type I IFN response in vitro and in moderate cases of COVID-19. In vitro stimulation of type I IFN expression and signaling in human airway epithelial cells is associated with activation of canonical transcriptions factors, and SARS-CoV-2 is unable to inhibit exogenous induction of these responses. Furthermore, we show that physiological levels of IFNα detected in patients with moderate COVID-19 is sufficient to suppress SARS-CoV-2 replication in human airway cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,119
Tête enseignante GPT0,433
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations73
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueiScienceMême sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 ResearchTravaux en français237 207