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Enregistrement W3158818008 · doi:10.3390/jof7050343

Molecular Modifications of the Pseudomonas Quinolone Signal in the Intermicrobial Competition with Aspergillus

2021· article· en· W3158818008 sur OpenAlexaff
Hasan Nazik, Gabriele Sass, Paul Williams, Éric Déziel, David A. Stevens

Notice bibliographique

RevueJournal of Fungi · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiofilmPseudomonas aeruginosaAspergillusQuorum sensingMicrobiologyPyoverdineBiologyVirulenceMetabolismPseudomonasSiderophoreBiochemistryIntracellularChemistryBacteriaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Pseudomonas quinolone signal (PQS) is an important quorum-sensing molecule for Pseudomonas aeruginosa that regulates virulence factors, chelates iron, and is an important factor in interactions with eukaryotes, including fungi and mammalian hosts. It was previously shown to inhibit or boost Aspergillus, depending on the milieu iron concentration. We studied several molecular modifications of the PQS molecule, and their effects on Aspergillus biofilm metabolism and growth in vitro, and the effects of iron supplementation. We found that most molecules inhibited Aspergillus at concentrations similar to that of PQS, but with relatively flat dose-responses, and all were less potent than PQS. The inhibition was reversible by iron, suggesting interference with fungal iron metabolism. Stimulation of Aspergillus was not noted. We conclude that the critical Aspergillus-inhibiting moeities of the PQS molecule were partially, but not completely, interfered with by molecular modifications at several sites on the PQS molecule. The mechanism, as with PQS, appears to relate to fungal iron metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,138

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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