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Enregistrement W3159019058 · doi:10.1038/s41597-021-00900-3

COVID-CT-MD, COVID-19 computed tomography scan dataset applicable in machine learning and deep learning

2021· article· en· W3159019058 sur OpenAlexafffund
Parnian Afshar, Shahin Heidarian, Nastaran Enshaei, Farnoosh Naderkhani, Moezedin Javad Rafiee, Anastasia Oikonomou, Faranak Babaki Fard, Kaveh Samimi, Konstantinos N. Plataniotis, Arash Mohammadi

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 diagnosis using AI
Établissements canadiensUniversité de MontréalHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreMcGill University Health CentreConcordia University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Computed tomographyArtificial intelligenceSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Chest radiographComputer sciencePneumoniaMedicineTomographyRadiologyMachine learningMedical physicsRadiographyInfectious disease (medical specialty)PathologyDiseaseInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Novel Coronavirus (COVID-19) has drastically overwhelmed more than 200 countries affecting millions and claiming almost 2 million lives, since its emergence in late 2019. This highly contagious disease can easily spread, and if not controlled in a timely fashion, can rapidly incapacitate healthcare systems. The current standard diagnosis method, the Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT- PCR), is time consuming, and subject to low sensitivity. Chest Radiograph (CXR), the first imaging modality to be used, is readily available and gives immediate results. However, it has notoriously lower sensitivity than Computed Tomography (CT), which can be used efficiently to complement other diagnostic methods. This paper introduces a new COVID-19 CT scan dataset, referred to as COVID-CT-MD, consisting of not only COVID-19 cases, but also healthy and participants infected by Community Acquired Pneumonia (CAP). COVID-CT-MD dataset, which is accompanied with lobe-level, slice-level and patient-level labels, has the potential to facilitate the COVID-19 research, in particular COVID-CT-MD can assist in development of advanced Machine Learning (ML) and Deep Neural Network (DNN) based solutions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,051

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations204
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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