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Enregistrement W3159118220 · doi:10.1371/journal.pone.0250778

Current trends in the application of causal inference methods to pooled longitudinal observational infectious disease studies—A protocol for a methodological systematic review

2021· article· en· W3159118220 sur OpenAlexafffund
Heather Hufstedler, Ellicott C. Matthay, Sabahat Rahman, Valentijn M. T. de Jong, Harlan Campbell, Paul Gustafson, Thomas P. A. Debray, Thomas Jaenisch, Lauren Maxwell, Till Bärnighausen

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueAdvanced Causal Inference Techniques
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsHorizon 2020Canadian Institutes of Health ResearchEuropean Commission
Mots-clésObservational studyCausal inferenceConfoundingPoolingPsychological interventionCINAHLMendelian randomizationSample size determinationClinical study designEconLitPropensity score matchingResearch designProtocol (science)MEDLINEComputer sciencePsychologyMedicineClinical trialStatisticsArtificial intelligenceBiologyAlternative medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Pooling (or combining) and analysing observational, longitudinal data at the individual level facilitates inference through increased sample sizes, allowing for joint estimation of study- and individual-level exposure variables, and better enabling the assessment of rare exposures and diseases. Empirical studies leveraging such methods when randomization is unethical or impractical have grown in the health sciences in recent years. The adoption of so-called "causal" methods to account for both/either measured and/or unmeasured confounders is an important addition to the methodological toolkit for understanding the distribution, progression, and consequences of infectious diseases (IDs) and interventions on IDs. In the face of the Covid-19 pandemic and in the absence of systematic randomization of exposures or interventions, the value of these methods is even more apparent. Yet to our knowledge, no studies have assessed how causal methods involving pooling individual-level, observational, longitudinal data are being applied in ID-related research. In this systematic review, we assess how these methods are used and reported in ID-related research over the last 10 years. Findings will facilitate evaluation of trends of causal methods for ID research and lead to concrete recommendations for how to apply these methods where gaps in methodological rigor are identified. METHODS AND ANALYSIS: We will apply MeSH and text terms to identify relevant studies from EBSCO (Academic Search Complete, Business Source Premier, CINAHL, EconLit with Full Text, PsychINFO), EMBASE, PubMed, and Web of Science. Eligible studies are those that apply causal methods to account for confounding when assessing the effects of an intervention or exposure on an ID-related outcome using pooled, individual-level data from 2 or more longitudinal, observational studies. Titles, abstracts, and full-text articles, will be independently screened by two reviewers using Covidence software. Discrepancies will be resolved by a third reviewer. This systematic review protocol has been registered with PROSPERO (CRD42020204104).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,033
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,544
Score d'incertitude au seuil0,975

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,033
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,770
Tête enseignante GPT0,614
Écart entre enseignants0,155 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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