Discovery of Siderophore and Metallophore Production in the Aerobic Anoxygenic Phototrophs
Notice bibliographique
Résumé
Aerobic anoxygenic phototrophs have been isolated from a rich variety of environments including marine ecosystems, freshwater and meromictic lakes, hypersaline springs, and biological soil crusts, all in the hopes of understanding their ecological niche. Over 100 isolates were chosen for this study, representing 44 species from 27 genera. Interactions with Fe3+ and other metal(loid) cations such as Mg2+, V3+, Mn2+, Co2+, Ni2+, Cu2+, Zn2+, Se4+ and Te2+ were tested using a chromeazurol S assay to detect siderophore or metallophore production, respectively. Representatives from 20 species in 14 genera of α-Proteobacteria, or 30% of strains, produced highly diffusible siderophores that could bind one or more metal(loid)s, with activity strength as follows: Fe > Zn > V > Te > Cu > Mn > Mg > Se > Ni > Co. In addition, γ-proteobacterial Chromocurvus halotolerans, strain EG19 excreted a brown compound into growth medium, which was purified and confirmed to act as a siderophore. It had an approximate size of ~341 Da and drew similarities to the siderophore rhodotorulic acid, a member of the hydroxamate group, previously found only among yeasts. This study is the first to discover siderophore production to be widespread among the aerobic anoxygenic phototrophs, which may be another key method of metal(loid) chelation and potential detoxification within their environments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».