Whole-Genome Study of a Multigenerational Family with Essential Tremor
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Essential tremor (ET) is a common movement disorder with ˜5% prevalence in individuals above the age of 65, but in rare cases, it arises during childhood. Growing evidence suggests the role of cerebellum in the disease mechanism. ET is highly heritable, however, poor replication of risk loci point to its significant heterogeneity. Thus, it is important to genetically investigate kindreds with a strong aggregation of ET. METHODS: We conducted a clinical and whole-genome investigation of a large Caucasian Canadian family, in which six out of eight patients are affected by childhood-onset ET in four consecutive generations. Eight family members were available for study, including three patients affected by ET. Whole-genome sequencing (WGS) was conducted for the four most informative individuals, followed by Sanger sequencing in the entire kindred. RESULTS: We searched for rare variants absent in the eldest unaffected individual, but present in the patients (two siblings and their third-degree relative). Our stringent whole-genome filtering approach revealed a rare heterozygous p. Arg90Gln substitution in TCP10L (rs151233771) in all three investigated patients. Sanger sequencing confirmed the p. Arg90Gln variant and revealed its absence in the rest of the family members. CONCLUSIONS: Whole-genome data of the family with ET resulted in a single candidate gene mapped to 21q22.11 locus (TCP10L) with the highest brain expression in cerebellum. Our study encourages future replication studies to validate the genetic link between TCP10L and ET, and suggests the p. Arg90Gln variant for functional investigation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».