Ume6 Acts as a Stable Platform To Coordinate Repression and Activation of Early Meiosis-Specific Genes in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>
Notice bibliographique
Résumé
In response to nutrient starvation, the budding yeast Saccharomyces cerevisiae abandons mitotic proliferation and embarks on a differentiation process that leads through meiosis to the formation of haploid spores. This process is driven by cascading waves of meiosis-specific-gene expression. The early meiosis-specific genes are repressed during mitotic proliferation by the DNA-binding protein Ume6 in combination with repressors Rpd3 and Sin3. The expression of meiosis-specific transcription factor Ime1 leads to activation of the early meiosis-specific genes. We investigated the stability and promoter occupancy of Ume6 in sporulating cells and determined that it remains bound to early meiosis-specific gene promoters when those genes are activated. Furthermore, we find that the repressor Rpd3 remains associated with Ume6 after the transactivator Ime1 has joined the complex and that the Gcn5 and Tra1 components of the SAGA complex bind to the promoter of IME2 in an Ime1-dependent fashion to induce transcription of the early meiosis-specific genes. Our investigation supports a model whereby Ume6 provides a platform allowing recruitment of both activating and repressing factors to coordinate the expression of the early meiosis-specific genes in Saccharomyces cerevisiae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».