MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3159489158 · doi:10.21423/aabppro20084484

Field Evaluation of the Finnzyme Mastitis Pathogen Detection System for Cows and Quarters Infected with Staphylococcus aureus

2008· article· en· W3159489158 sur OpenAlexaff
C.R. Friendship, D.F. Kelton, K.E. Leslie

Notice bibliographique

RevueAmerican Association of Bovine Practitioners Conference Proceedings · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMilk Quality and Mastitis in Dairy Cows
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStaphylococcus aureusMastitisSomatic cell countCalifornia mastitis testSubclinical infectionPathogenHerdMicrobiological cultureMicrobiologyMedicineBiologyVeterinary medicineImmunologyVirologyBacteriaLactation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Staphylococcus aureus, a contagious pathogen, is one of the most important etiological agents of chronic, clinical and subclinical mastitis (Studer et al, 2008). S. aureus damages milk-producing tissue and significantly decreases milk production. Since damage is minimal and reversible in early infection and this infection is contagious, it would be advantageous to have a reliable and sensitive detection system in place to identify early infections in order that treatment and management to prevent spread could occur. Subclinical S. aureus infections are usually associated with elevated somatic cell counts (SCC) and confirmed by bacteriologic culture. Some significant limitations to the traditional culturebased systems for identifying S. aureus exist. Sears et al (1990) determined that even under ideal conditions the sensitivity of culturing quarter samples only reached 74.5%. Also, due to the cyclical nature of the shedding of S. aureus, the culture of samples collected over multiple days is necessary to conclusively establish the S. aureus infection status of a quarter. A real-time PCR-based reagent kit for bovine mastitis has been developed by Finnzymes. While more expensive than traditional culture-based systems, this system has a distinct advantage in that it can be applied to metered milk samples collected for general milk recording purposes by most Dairy Herd Improvement (DHI) organizations. The Finnzymes test system has been shown to be accurate in the detection of most mastitis-associated pathogens in laboratory testing. It has been proposed that this PCR-based test may be more convenient and more accurate than traditional culture-based systems in identifying cows with subclinical S. aureus infections. The first objective of this pilot project is to measure the agreement between a PCR-based diagnostic system and a culture-based system for identifying S. aureus infected cows and quarters. The second objective is to determine the cause(s) of disagreement that may occur between the two test systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,621
Score d'incertitude au seuil0,205

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAmerican Association of Bovine Practitioners Conference ProceedingsMême sujetMilk Quality and Mastitis in Dairy CowsTravaux en français237 207