Estimating the Instantaneous Asymptomatic Proportion With a Simple Approach: Exemplified With the Publicly Available COVID-19 Surveillance Data in Hong Kong
Notice bibliographique
Résumé
Background: The asymptomatic proportion is a critical epidemiological characteristic that modulates the pandemic potential of emerging respiratory virus, which may vary depending on the nature of the disease source, population characteristics, source–host interaction, and environmental factors. Methods: We developed a simple likelihood-based framework to estimate the instantaneous asymptomatic proportion of infectious diseases. Taking the COVID-19 epidemics in Hong Kong as a case study, we applied the estimation framework to estimate the reported asymptomatic proportion (rAP) using the publicly available surveillance data. We divided the time series of daily cases into four stages of epidemics in Hong Kong by examining the persistency of the epidemic and compared the rAPs of imported cases and local cases at different stages. Results: As of July 31, 2020, there were two intermittent epidemics in Hong Kong. The first one was dominated by imported cases, accounting for 63.2% of the total cases, and the second one was dominated by local cases, accounting for 86.5% of the total cases. The rAP was estimated at 23.1% (95% CI: 10.8–39.7%) from January 23 to July 31, and the rAPs were estimated at 22.6% (95% CI: 11.1–38.9%) among local cases and 38.7% (95% CI: 9.0–72.0%) among imported cases. Our results showed that the rAPs of local cases were not significantly different between the two epidemics, but increased gradually during the first epidemic period. In contrast, the rAPs of imported cases in the latter epidemic period were significantly higher than that in the previous epidemic period. Conclusion: Hong Kong has a high rAP of imported COVID-19 cases and should continue to strengthen the detection and isolation of imported individuals to prevent the resurgence of the disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,016 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».