ARDS metabolic fingerprints: characterization, benchmarking, and potential mechanistic interpretation
Notice bibliographique
Résumé
In this study, we aimed to identify acute respiratory distress syndrome (ARDS) metabolic fingerprints in selected patient cohorts and compare the metabolic profiles of direct versus indirect ARDS and hypoinflammatory versus hyperinflammatory ARDS. We hypothesized that the biological and inflammatory processes in ARDS would manifest as unique metabolomic fingerprints that set ARDS apart from other intensive care unit (ICU) conditions and could help examine ARDS subphenotypes and clinical subgroups. Patients with ARDS ( n = 108) and ICU ventilated controls ( n = 27) were included. Samples were randomly divided into 2/3 training and 1/3 test sets. Samples were analyzed using 1H nuclear magnetic resonance spectroscopy and gas chromatography-mass spectrometry. Twelve proteins/cytokines were also measured. Orthogonal partial least squares discriminant analysis (OPLS-DA) was used to select the most differentiating ARDS metabolites and protein/cytokines. Predictive performance of OPLS-DA models was measured in the test set. Temporal changes of metabolites were examined as patients progressed through ARDS until clinical recovery. Metabolic profiles of direct versus indirect ARDS subgroups and hypoinflammatory versus hyperinflammatory ARDS subgroups were compared. Serum metabolomics and proteins/cytokines had similar area under receiver operator curves when distinguishing ARDS from ICU controls. Pathway analysis of ARDS differentiating metabolites identified a dominant involvement of serine-glycine metabolism. In longitudinal tracking, the identified pathway metabolites generally exhibited correction by 7−14 days, coinciding with clinical improvement. ARDS subphenotypes and clinical subgroups were metabolically distinct. However, our identified metabolic fingerprints are not ARDS diagnostic biomarkers, and further research is required to ascertain generalizability. In conclusion, patients with ARDS are metabolically different from ICU controls. ARDS subphenotypes and clinical subgroups are metabolically distinct.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».