CrpP Is Not a Fluoroquinolone-Inactivating Enzyme
Notice bibliographique
Résumé
Enzyme-mediated antibiotic inactivation is a common mechanism of drug resistance in bacteria (1). The genes encoding these resistance proteins are frequently associated with mobile elements, making them particularly concerning due to their propensity for horizontal transfer through bacterial populations. Given the specificity of enzymes for their substrates, which has often coevolved with antibiotic production over millennia (2), it is not surprising that natural-product antibiotics and their semisynthetic derivatives are particularly vulnerable to enzymatic inactivation. Various hydrolases (β-lactams), kinases (aminoglycosides and macrolides), nucleotidyltransferases (lincosamides and aminoglycosides), acyltransferases (chloramphenicol and aminoglycosides), oxygenases (tetracyclines and rifamycins), and many others are known. In contrast, enzyme-mediated inactivation of synthetic antibiotics is rare. Examples include monooxygenase-mediated inactivation of sulfonamides by soil bacteria (3) and coopting of an aminoglycoside acetyltransferase, AAC(6′)-Ib-cr, for the modification of fluoroquinolone antibiotics containing a piperazine moiety with a free secondary amine, such as ciprofloxacin (CIP) and norfloxacin (4, 5).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,010 | 0,006 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,006 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».