SBEM protein expression correlates with estrogen receptor and tumor grade in breast cancer.
Notice bibliographique
Résumé
3282 We recently identified small breast epithelial mucin (SBEM) as a novel 90 amino-acid protein, the expression of which appears to be highly breast-specific. Structurally, this protein contains tandem repeats of the octapeptide neutral core sequence TTAAXTTA, that is characteristic of the large family of glycoproteins known as mucins. Since the epithelial surface mucin, MUC1, a member of this family, is abnormally glycosylated and its expression is up-regulated in breast cancer, we were interested in examining protein expression of SBEM in breast cancer cell lines, normal breast tissue and breast tumors. Western blot analysis of eight different breast cancer cell lines indicated variable SBEM protein expression. The MDA-231 and BT-20 cell lines exhibited high expression of SBEM protein, while the T5 and MCF-7 cell lines expressed SBEM at lower levels. In normal mammary tissue, SBEM was present, but there was a low level of expression. 88 breast tumors were analyzed by Western blot, and were classified as being SBEM-positive (n = 64) or SBEM-negative (n = 24). When compared to ER levels, SBEM positive tumors demonstrated lower ER levels (22.5fmol/mg) than SBEM negative tumors (63.0fmol/mg). There was also a positive correlation between SBEM level and tumor grade (P = 0.02). No correlation between SBEM and PR levels was observed (P = 0.71). All other normal tissues studied were negative for SBEM protein. These data suggest that a higher expression of the SBEM protein could help monitor breast cancer progression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».