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Enregistrement W3160423922 · doi:10.24871/221202142-51

The clinical features of COVID-19 patients with positive viral RNA stool test results and possibility of fecal-oral transmission : A Systematic Review

2021· review· en· W3160423922 sur OpenAlexaboutno aff
Selina Natalia, Felicia Imanuella Thorion, Luky Adlino, Clifford Eltin John, Andree Kurniawan, Nata Pratama Hardjo Lugito

Notice bibliographique

RevueThe Indonesian Journal of Gastroenterology Hepatology and Digestive Endoscopy · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineTransmission (telecommunications)FecesObservational studyInternal medicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)OutbreakClinical trialRandomized controlled trialSystematic reviewDiseaseMEDLINEVirologyInfectious disease (medical specialty)Biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective : Coronavirus disease 2019 (COVID-19) has been declared as an international public health emergency by the World Health Organization (WHO), with outbreaks in over 200 countries and causing over 390,000 deaths globally. ACE-2 receptors are highly expressed in the upper and lower gastrointestinal system, providing a prerequisite for SARS-CoV-2 infection in the gastrointestinal tract. In addition, over half of the COVID-19 patients have viral nucleic acid detected in their feces and almost one-quarter of the cases, the stool samples test positive even when respiratory samples are negative. The aim of this systematic review is to summarize literature and to evaluate the clinical characteristics of patients with positive viral RNA stool test for COVID-19 and if there is a possibility of fecal-oral transmission of SARS-CoV-2 virus.Method : This systematic review has been registered in PROSPERO (CRD42020183049). A systematic search of the literature for observational study and randomized control trial was conducted in PubMed central and Google Scholar through May 5th, 2020. Three reviewers independently searched and selected. The risk of bias was evaluated using Newcastle-Ottawa Quality assessment tool.Results : 340 articles were screened, then from which eight articles were selected. Of eight articles that were included in this study, we sought for three main categories of the clinical manifestation; gastrointestinal, respiratory, and others. Each study was reviewed systematically to gain demographic data and evidence regarding the possibility of fecal oral transmission in SARS-CoV-2. Two studies reported prolongation of positive stool test results after the respiratory specimen conversion to negative which support the theory of fecal oral transmission.Conclusion : In conclusion, diarrhea, cough, and fever are the most common clinical manifestations in COVID-19 patients with positive RNA stool test results. Fecal oral transmission may be possible due to the ACE-2 receptors in the lining of the gastrointestinal tract. RNA stool test should be used as addition in discharging COVID-19 patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,031
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,031
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,007
Bibliométrie0,0130,013
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,415
Écart entre enseignants0,377 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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