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Enregistrement W3160536604 · doi:10.1101/2021.05.19.444856

Transcriptomics of improved fruit retention by hexanal in ‘Honeycrisp’ reveals hormonal crosstalk and reduced cell-wall remodelling in the fruit-abscission zone

2021· preprint· en· W3160536604 sur OpenAlexafffund
Karthika Sriskantharajah, Walid El Kayal, Davoud Torkamaneh, Murali‐Mohan Ayyanath, Praveen K. Saxena, Alan Sullivan, Gopinadhan Paliyath, Jayasankar Subramanian

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePostharvest Quality and Shelf Life Management
Établissements canadiensMinistère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'AlimentationVineland Research and Innovation CentreUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesArrell Food Institute, University of GuelphGlobal Affairs CanadaInternational Development Research CentreOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsGovernment of CanadaUniversity of Guelph
Mots-clésHexanalAbscissionEthyleneAbscisic acidMalusBiologyGibberellinBiochemistryChemistryCell biologyBotanyGeneFood science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Apples ( Malus domestica Borkh) are prone to pre-harvest fruit drop which is more pronounced in ‘Honeycrisp’. Using a transcriptomic approach, we analyzed the molecular mechanisms of fruit retention in ‘Honeycrisp’. A total of 726 differentially expressed genes (DEGs) were identified in the abscission zone of hexanal-treated and untreated fruit (FAZ). Hexanal down-regulated the genes involved in ethylene biosynthesis, such as S-adenosylmethionine synthase ( SAM2 ) and 1-aminocyclopropane-1carboxylic acid oxidases ( ACO3 , ACO4 and ACO4 - like ). Genes related to ABA biosynthesis ( FDPS and CLE25 ) were also down-regulated. On the contrary, gibberellic acid (GA) biosynthesis genes, gibberellin 20 oxidase1-like ( GA20OX - like ) and ent-kaurene oxidase ( KO ) were up-regulated. Further, hexanal down-regulated the expression of genes related to cell-wall remodelling enzymes such as polygalacturonase ( PG1 ), glucanases (endo-β-1,4-glucanase; EG) and expansins ( EXPA1 - like, EXPA6, EXPA8, EXPA10 - like, EXPA16 - like ). Hexanal also reduced ethylene, and abscisic acid (ABA) production at commercial harvest stage. Hexanal reduced ethylene production in fruits and thus reduced the sensitivity of FAZ cells to ethylene and ABA. Simultaneously, hexanal maintained the cell-wall integrity of FAZ cells by regulating genes involved in cell-wall modifications. Our findings show that fruit abscission is delayed by hexanal, by down regulating ABA through an ethylene-dependent mechanism. Highlight Hexanal, a naturally occurring plant compound, increased fruit retention in apples by decreasing ethylene and ABA production and maintaining the cell-wall integrity in the fruit abscission zone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,752
Score d'incertitude au seuil0,870

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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