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Enregistrement W3160735031 · doi:10.11575/prism/38850

Quantifying the impacts of inbreeding depression on adult reproductive success, survival, and foal birth in the feral horses (Equus ferus caballus) of Sable Island, Nova Scotia

2021· dissertation· en· W3160735031 sur OpenAlexaboutno aff
Chanwoori Jeong

Notice bibliographique

RevuePRISM (University of Calgary) · 2021
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInbreeding depressionFoalNova scotiaEquusBiologyZoologyInbreedingEcologyReproductionGeographyDemographyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inbreeding, the mating between related individuals, often adversely affects individual fitness in a phenomenon known as inbreeding depression (ID). Small and genetically-isolated populations are especially vulnerable to ID, making understanding its causes and consequences important from a wildlife conservation perspective. Quantifying ID in wildlife is challenging, as there are difficulties with collecting long-term life history data needed to estimate fitness and high-quality genetic data needed to precisely estimate inbreeding, especially in free-living populations. In my thesis, I studied ID in the isolated feral horse population of Sable Island, Nova Scotia, by combining individual-based genomic, ecological and life history data from 239 individuals. Genomic data was generated using Single Nucleotide Polymorphism (SNP) arrays, and inbreeding levels were quantified through genomic estimators based on SNPs found in runs of homozygosity, FROH, correlation between uniting gametes, FUNI, and pairwise relatedness. I tested for presence of ID on sex-specific annual adult reproductive success and survival as well as foal births, and the influence of intrinsic and extrinsic variables in modulating ID using generalized linear mixed models and model averaging. Low overall levels of inbreeding was found in the population, and inbreeding was not a significant predictor of any of the fitness traits studied when considered on its own. However, results suggested that ID for female annual reproductive success, female annual survival, and male annual survival may be modulated by environmental conditions such as band size, location, and winter severity. The performance of the estimators FROH and FUNI were similar throughout my analyses. Using a standardized measure of ID, I also show that ID in Sable Island horses is relatively low in comparison to other wildlife populations. This research expands our knowledge of inbreeding depression in natural systems and provides Parks Canada with important information to assist with the management and conservation of Sable Island’s iconic population of feral horses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,728
Score d'incertitude au seuil0,541

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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