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Enregistrement W3160971999 · doi:10.1101/gad.343871.120

Small RNAs guide histone methylation in <i>Arabidopsis</i> embryos

2021· article· en· W3160971999 sur OpenAlexaff
Jean‐Sébastien Parent, Jonathan Cahn, Rowan P. Herridge, Daniel Grimanelli, Robert A. Martienssen

Notice bibliographique

RevueGenes & Development · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsNational Institute of General Medical SciencesNational Science FoundationNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteHoward Hughes Medical InstituteAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésBiologyReprogrammingDNA methylationEpigeneticsHistoneHistone H3RNA-Directed DNA MethylationHeterochromatinHistone methylationMethylationEpigenomicsGeneticsCell biologyChromatinDNAGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epigenetic reprogramming occurs during gametogenesis as well as during embryogenesis to reset the genome for early development. In flowering plants, many heterochromatic marks are maintained in sperm, but asymmetric DNA methylation is mostly lost. Asymmetric DNA methylation is dependent on small RNA but the re-establishment of silencing in embryo is not well understood. Here we demonstrate that small RNAs direct the histone H3 lysine 9 dimethylation during Arabidopsis thaliana embryonic development, together with asymmetric DNA methylation. This de novo silencing mechanism depends on the catalytic domain of SUVH9, a Su(Var)3-9 homolog thought to be catalytically inactive.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,381
Score d'incertitude au seuil0,236

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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