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Enregistrement W3161027543 · doi:10.2196/29667

A Word Pair Dataset for Semantic Similarity and Relatedness in Korean Medical Vocabulary: Reference Development and Validation

2021· article· en· W3161027543 sur OpenAlexvenueno aff
Yunjin Yum, Jeong Moon Lee, Moon Joung Jang, Yoojoong Kim, Jong-Ho Kim, Seongtae Kim, Unsub Shin, Sanghoun Song, Hyung Joon Joo

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Informatics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKorea Health Industry Development Institute
Mots-clésNatural language processingComputer scienceSimilarity (geometry)VocabularyWord (group theory)Word embeddingTask (project management)Artificial intelligenceSemantic similaritySet (abstract data type)Health informaticsInformation retrievalUnified Medical Language SystemEmbeddingLinguisticsMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The fact that medical terms require special expertise and are becoming increasingly complex makes it difficult to employ natural language processing techniques in medical informatics. Several human-validated reference standards for medical terms have been developed to evaluate word embedding models using the semantic similarity and relatedness of medical word pairs. However, there are very few reference standards in non-English languages. In addition, because the existing reference standards were developed a long time ago, there is a need to develop an updated standard to represent recent findings in medical sciences. OBJECTIVE: We propose a new Korean word pair reference set to verify embedding models. METHODS: From January 2010 to December 2020, 518 medical textbooks, 72,844 health information news, and 15,698 medical research articles were collected, and the top 10,000 medical terms were selected to develop medical word pairs. Attending physicians (n=16) participated in the verification of the developed set with 607 word pairs. RESULTS: The proportion of word pairs answered by all participants was 90.8% (551/607) for the similarity task and 86.5% (525/605) for the relatedness task. The similarity and relatedness of the word pair showed a high correlation (ρ=0.70, P<.001). The intraclass correlation coefficients to assess the interrater agreements of the word pair sets were 0.47 on the similarity task and 0.53 on the relatedness task. The final reference standard was 604 word pairs for the similarity task and 599 word pairs for relatedness, excluding word pairs with answers corresponding to outliers and word pairs that were answered by less than 50% of all the respondents. When FastText models were applied to the final reference standard word pair sets, the embedding models learning medical documents had a higher correlation between the calculated cosine similarity scores compared to human-judged similarity and relatedness scores (namu, ρ=0.12 vs with medical text for the similarity task, ρ=0.47; namu, ρ=0.02 vs with medical text for the relatedness task, ρ=0.30). CONCLUSIONS: Korean medical word pair reference standard sets for semantic similarity and relatedness were developed based on medical documents from the past 10 years. It is expected that our word pair reference sets will be actively utilized in the development of medical and multilingual natural language processing technology in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,914
Score d'incertitude au seuil0,434

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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