MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3161096454 · doi:10.3389/fvets.2021.654125

Prevalence of Antimicrobial Resistance and Characteristics of Escherichia coli Isolates From Fecal and Manure Pit Samples on Dairy Farms in the Province of Québec, Canada

2021· article· en· W3161096454 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Veterinary Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversité de MontréalFonds de Recherche du Québec – Nature et TechnologiesCegep de Saint Hyacinthe
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Mots-clésEscherichia coliAntibiotic resistanceTetracyclineFecesManureVeterinary medicineBiologyAntimicrobialMicrobiologyDairy cattleAntibioticsMedicineAnimal scienceGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antimicrobial resistance (AMR) is an important burden for public health and veterinary medicine. For Québec (Canada) dairy farms, the prevalence of AMR is mostly described using passive surveillance, which may be misleading. In addition, the presence of extended spectrum β-lactamase (ESBL)/AmpC producing Escherichia coli is unknown. This observational cross-sectional study used random dairy farms ( n = 101) to investigate AMR and extended spectrum β-lactamase (ESBL)/AmpC producing Escherichia coli . Twenty antimicrobials were tested on E. coli isolates ( n = 593) recovered from fecal samples ( n = 599) from calves, cows, and the manure pit. Isolates were mostly susceptible (3% AMR or less) to the highest priority critically important antimicrobials in humans. The highest levels of AMR were to tetracycline (26%), sulfisozaxole (23%) and streptomycin (19%). The resistance genes responsible for these resistances were, respectively : tet (A) , tet (B), sul 1 , sul 2 , sul 3 , aph( 3” )-Ib (str A ), aph( 6 )-Id (str B ), aad A1 , aad A2, and aad A5. ESBL analysis revealed two predominant phenotypes: AmpC (51%) and ESBL (46%) where bla CMY−2 and bla CTX−M ( bla CTX−M−1 , bla CTX−M−15 , and bla CTX−M−55) were the genes responsible for these phenotypes, respectively. During this study, 85% of farms had at least one ESBL/AmpC producing E. coli . Isolates from calves were more frequently resistant than those from cows or manure pits. Although prevalence of AMR was low for critically important antimicrobials, there was a high prevalence of ESBL/AmpC-producing E. coli on Quebec dairy farms, particularly in calves. Those data will help determine a baseline for AMR to evaluate impact of initiatives aimed at reducing AMR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,679
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle