Abstract 16544: Small Rna-sequencing Analysis of Circulating Proinflammatory Microrna Following Murine Myocardial Ischemia/reperfusion Injury
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Transient myocardial ischemic/reperfusion injury (I/R) leads to cellular RNA release into extracellular (ex) space. Ex-RNAs and certain uridine-rich miRNAs activate innate immune response via TLR7-MyD88 pathway. Systemic administration of RNase reduces myocardial inflammation and infarct size after I/R, suggesting a pivotal role of ex-RNA in I/R injury. However, the nature of plasma RNAs and their biological functions in inflammation are not well understood. Hypothesis: Multiple plasma miRNAs are elevated in response to myocardial I/R injury and some are proinflammatory. Methods: Myocardial I/R injury was created in C57BL/6 mice by thoracotomy and 45 min of left anterior descending (LAD) ligation followed by 4 h of reperfusion. Sham mice underwent same procedure without LAD ligation. Plasma RNA was extracted using Trizol LS with Cel-miR-39 as spiked-in and quantified by RNA Quant-it kits. The plasma RNA was used to create cDNA libraries for small RNA sequencing (Norgen, Canada). Three abundant miRNAs that were differentially expressed between sham and I/R groups were tested for their proinflammatory effect. Results: Myocardial I/R led to a marked increase in plasma troponin (392.1±324.6 vs. 17.9±9.9ng/ml, P<0.05) and RNA levels (163±129 vs. 81±40 ng/ml) as compared with sham mice ( Fig. A ). Plasma RNA-Seq revealed miRNA was the predominate biotype constituting of 85.7% and 79.2% of plasma RNA in sham and I/R mice, respectively ( Fig. B ). We validated three miRNA expressions using qRT-PCR and found miR191-5p, miR125a-5p, and miR125b-5p were substantially increased ( Fig. C ). When incubated with macrophage cultures, miR125a-5p and miR-125b-5p, but not miR-191-5p, induced a dose-dependent response in CXCL-2 and IL-6 productions ( Fig. D ). Conclusions: Myocardial I/R injury results in an increase in multiple miRNAs in plasma. miR125a-5p and miR125b-5p, but not miR-191-5p, are pro-inflammatory in macrophages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».