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Enregistrement W3161602968 · doi:10.1007/s12021-021-09516-9

The C-BIG Repository: an Institution-Level Open Science Platform

2021· article· en· W3161602968 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueNeuroinformatics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell Image Analysis Techniques
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health CentreMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondation Brain CanadaMcGill University
Mots-clésOpen scienceComputer scienceWorld Wide WebInstitutionData scienceBig dataOpen sourceSoftwareProgramming languageData miningSociologyPhysicsSocial science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In January 2016, the Montreal Neurological Institute-Hospital (The Neuro) declared itself an Open Science organization. This vision extends beyond efforts by individual scientists seeking to release individual datasets, software tools, or building platforms that provide for the free dissemination of such information. It involves multiple stakeholders and an infrastructure that considers governance, ethics, computational resourcing, physical design, workflows, training, education, and intra-institutional reporting structures. The C-BIG repository was built in response as The Neuro's institutional biospecimen and clinical data repository, and collects biospecimens as well as clinical, imaging, and genetic data from patients with neurological disease and healthy controls. It is aimed at helping scientific investigators, in both academia and industry, advance our understanding of neurological diseases and accelerate the development of treatments. As many neurological diseases are quite rare, they present several challenges to researchers due to their small patient populations. Overcoming these challenges required the aggregation of datasets from various projects and locations. The C-BIG repository achieves this goal and stands as a scalable working model for institutions to collect, track, curate, archive, and disseminate multimodal data from patients. In November 2020, a Registered Access layer was made available to the wider research community at https://cbigr-open.loris.ca , and in May 2021 fully open data will be released to complement the Registered Access data. This article outlines many of the aspects of The Neuro's transition to Open Science by describing the data to be released, C-BIG's full capabilities, and the design aspects that were implemented for effective data sharing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,140
Score d'incertitude au seuil0,645

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle