High-resolution cryo-EM structure of the EspA filament from EPEC: revealing the mechanism of effector translocation in the type 3 secretion system
Notice bibliographique
Résumé
Antimicrobial resistance (AMR) is a growing concern for the global population, predominantly in animal husbandry, hospitals, and developing countries. Several pathogens are of particular concern, including Pseudomonas aeruginosa and Enterobacter spp. (Escherichia coli). The rise in AMR has contributed to the decline in development of novel antibiotics, thus pushing the world closer to a pre-antibiotic era. Virulence mechanisms that bacteria use are often not required for their survival and therefore are promising targets for the development of anti-virulence compounds. The type III secretion system (T3SS) is a highly conserved virulence mechanism employed by several Gram-negative pathogens, such as those discussed above. The T3SS is a syringe-like proteinaceous channel that spans the inner and outer membranes of the bacterial cell, projecting into the extracellular medium where it interacts with the host cell membrane to deliver proteinaceous virulence factors. The main components of the T3SS are: (1) the basal body, spanning the inner and outer membranes of the bacterial cell;
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».