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Rare Copy Number Variants (CNVs) and Breast Cancer Risk
Joe Dennis, Jonathan P. Tyrer, Logan C. Walker, Kyriaki Michailidou, Leila Dorling, Manjeet Bola, Qin Wang, Thomas U. Ahearn, Irene L. Andrulis, Hoda Anton‐Culver, Natalia Antonenkova, Volker Arndt, Kristan J. Aronson, Laura Beane Freeman, Matthias W. Beckmann, Sabine Behrens, Javier Benı́tez, Marina Bermisheva, Stig Bojeson, Hermann Brenner, Jose E. Castelao, Jenny Chang‐Claude, Georgia Chenevix‐Trench, Christine L. Clarke, NBCS Collaborators, J. Margriet Collée, Fergus J. Couch, Angela Cox, Simon S. Cross, Kamila Czene, Peter Devilee, Thilo Dörk, Laure Dossus, A. Heather Eliassen, Mikael Eriksson, D. Gareth Evans, Peter A. Fasching, Jonine D. Figueroa, Olivia Fletcher, Henrik Flyger, Lin Fritschi, Marike Gabrielson, Manuela Gago-Domínguez, Montserrat García‐Closas, Graham G. Giles, Anna González‐Neira, Pascal Guénel, Eric Hahen, Christopher A. Haiman, Per Hall, Antoinette Hollestelle, Reine Hoppe, John L. Hopper, Anthony Howell, ACTB Investigators, kConFab Investigators, Agnes Jager, Anna Jakubowska, Esther M. John, Nichola Johnson, Michael E. Jones, Audrey Jung, Rudolf Kaaks, Renske Keeman, Э. К. Хуснутдинова, Cari M. Kitahara, Yon‐Dschun Ko, Veli‐Matti Kosma, Stella Koutros, Peter Kraft, Vessela N. Kristensen, Katerina Kubelka‐Sabit, Alison Kurian, Diether Lambrechts, Nicole L. Larson, Martha S. Linet, Alicja Łukomska, Arto Mannermaa, Siranoush Manoukian, Sara Margolin, Dimitrios Mavroudis, Roger L. Milne, Taru Muranen, Rachel A. Murphy, Heli Nevanlinna, Janet E. Olson, Håkan Olsson, Tjoung‐Won Park‐Simon, Charles M. Perou, Paolo Peterlongo, Dijana Plaseska-Karanfilska, Katri Pylkäs, Gad Rennert, Emmanouil Saloustros, Dale P. Sandler, Elinor J. Sawyer, Marjanka K. Schmidt, Rita K. Schmutzler, Rana Shibli, Ann Smeets, Penny Soucy, Melissa C. Southey, Anthony J. Swerdlow, Rulla M. Tamimi, Jack A. Taylor, Lauren R. Teras, Mary Beth Terry, Ian Tomlinson, Melissa A. Troester, Thérèse Truong, Celine M. Vachon, Camilla Wendt, Robert Winqvist, Alicja Wolk, Xiaohong R. Yang, Wei Zheng, Argyrios Ziogas, Jacques Simard, Alison M. Dunning, Paul D.P. Pharoah, Douglas F. Easton
Notice bibliographique
RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier de l'Université LavalCentre hospitalier universitaire de QuébecUniversity of British ColumbiaQueen's UniversityInstitute of Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandServicio Gallego de SaludUniversitätsklinikum Hamburg-EppendorfInstituto de Salud Carlos IIICancer Council TasmaniaWorld Cancer Research FundMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchManchester Biomedical Research CentreNational Institute of Environmental Health SciencesU.S. ArmyImperial Experimental Cancer Medicine CentreNational Institutes of HealthHellenic Health FoundationDeutschen Konsortium für Translationale KrebsforschungXunta de GaliciaMutuelle Générale de l'Education NationaleInstitut Gustave-RoussyMinistero dello Sviluppo EconomicoNational Health and Medical Research CouncilOulun YliopistoDeutsche KrebshilfeCenters for Disease Control and PreventionInstitut National Du CancerLeids Universitair Medisch CentrumAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroKWF KankerbestrijdingVetenskapsrådetLigue Contre le CancerUniversity of CreteInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleCancer Council South AustraliaAmerican Cancer SocietyFonds Wetenschappelijk OnderzoekCancerfondenNational Cancer InstituteUniversity College LondonCancer Institute NSWCancer Council Western AustraliaEuropean CommissionResearch Promotion FoundationAcademy of FinlandKing's College LondonEberhard Karls Universität TübingenFondation du cancer du sein du QuébecGénome QuébecMinisterio de Economía y CompetitividadOvarian Cancer Research FundBundesministerium für Bildung und ForschungNational Breast Cancer FoundationAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailSwedish Cancer FoundationAgency for Science, Technology and ResearchLon V. Smith FoundationMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationUniversity of CaliforniaKreftforeningenDavid F. and Margaret T. Grohne Family FoundationGenome CanadaSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådCentre International de Recherche sur le CancerDeutsches KrebsforschungszentrumDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungDeutsche ForschungsgemeinschaftGentofte HospitalNational Institute for Health and Care ResearchHarvard T.H. Chan School of Public HealthNorges ForskningsrådDivision of Cancer Prevention, National Cancer InstituteCancer Council VictoriaCalifornia Department of Public HealthBrigham and Women's HospitalCancer AustraliaAgence Nationale de la RechercheRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnOak FoundationMinisterio de Sanidad, Servicios Sociales e IgualdadGovernment of CanadaUniversity of CambridgeMcGill UniversityBreast Cancer Research FoundationCancer Council NSWSusan G. Komen for the CureFondation de FranceNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchUniversity of California, San FranciscoU.S. Department of Health and Human ServicesCancer Research UKStavros Niarchos FoundationUniversity of Southern CaliforniaRoyal Society Te Apārangi
Mots-clésCopy-number variationBreast cancerGeneticsMedicineCancerBiologyGeneGenome
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,023
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentnon