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Enregistrement W3161997410 · doi:10.1016/j.jcmg.2021.03.020

A Machine-Learning Framework to Identify Distinct Phenotypes of Aortic Stenosis Severity

2021· article· en· W3161997410 sur OpenAlexafffund
Partho P. Sengupta, Sirish Shrestha, Nobuyuki Kagiyama, Yasmin S. Hamirani, Hemant Kulkarni, Naveena Yanamala, Rong Bing, Calvin Chin, Tania Pawade, David Messika–Zeitoun, Lionel Tastet, Mylène Shen, David E. Newby, Marie‐Annick Clavel, Phillippe Pibarot, Marc R. Dweck, Éric Larose, Ezéquiel Guzzetti, Mathieu Bernier, Jonathan Beaudoin, Marie Arsenault, Nancy Côté, Russell J. Everett, William Jenkins, Christophe Tribouilloy, Julien Dreyfus, Tiffany Mathieu, C. Renard, Mesut Gun, Laurent Macron, Jacob W. Sechrist, Joan M. Lacomis, Virginia Nguyen, Laura Galián-Gay, Ioannis Ntalas, Bernard Prendergast, Ronak Rajani, Arturo Evangelista, João L. Cavalcante

Notice bibliographique

RevueJACC. Cardiovascular imaging · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Valve Diseases and Treatments
Établissements canadiensInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversité LavalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchBritish Heart FoundationWellcome TrustNational Institute of General Medical SciencesNational Sleep FoundationNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésMedicineInternal medicineCohortCardiologyMagnetic resonance imagingStenosisSeverity of illnessAortic valve replacementRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The authors explored the development and validation of machine-learning models for augmenting the echocardiographic grading of aortic stenosis (AS) severity. BACKGROUND: In AS, symptoms and adverse events develop secondarily to valvular obstruction and left ventricular decompensation. The current echocardiographic grading of AS severity focuses on the valve and is limited by diagnostic uncertainty. METHODS: Using echocardiography (ECHO) measurements (ECHO cohort, n = 1,052), we performed patient similarity analysis to derive high-severity and low-severity phenogroups of AS. We subsequently developed a supervised machine-learning classifier and validated its performance with independent markers of disease severity obtained using computed tomography (CT) (CT cohort, n = 752) and cardiovascular magnetic resonance (CMR) imaging (CMR cohort, n = 160). The classifier's prognostic value was further validated using clinical outcomes (aortic valve replacement [AVR] and death) observed in the ECHO and CMR cohorts. RESULTS: In 1,964 patients from the 3 multi-institutional cohorts, 1,346 (68%) subjects had either nonsevere or discordant AS severity. Machine learning identified 1,117 (57%) patients as having high-severity and 847 (43%) as having low-severity AS. High-severity patients in CT and CMR cohorts had higher valve calcium scores and left ventricular mass and fibrosis, respectively than the low-severity group. In the ECHO cohort, progression to AVR and progression to death in patients who did not receive AVR was faster in the high-severity group. Compared with the conventional classification of disease severity, machine-learning-based severity classification improved discrimination (integrated discrimination improvement: 0.07; 95% confidence interval: 0.02 to 0.12) and reclassification (net reclassification improvement: 0.17; 95% confidence interval: 0.11 to 0.23) for the outcome of AVR at 5 years. For both ECHO and CMR cohorts, we observed prognostic value of the machine-learning classifications for subgroups with asymptomatic, nonsevere or discordant AS. CONCLUSIONS: Machine learning can integrate ECHO measurements to augment the classification of disease severity in most patients with AS, with major potential to optimize the timing of AVR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations87
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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