Biogeography of ITS Variation in the <i>Helenium autumnale</i> (Asteraceae) Species Complex
Notice bibliographique
Résumé
Abstract—We used ITS sequences as species barcodes to evaluate 127 samples of 12 Helenium species from the eastern and central USA, focusing on a species complex of H. autumnale (76 sequences from 11 U.S. states and two Canadian provinces), the federally “threatened” H. virginicum, now recommended for delisting (30 sequences from three U.S. states), and H. flexuosum (11 sequences from four U.S. states). ITS sequences confirmed most species identifications and supported the presence of the first population of the “threatened” endemic Missouri-Virginia disjunct, Helenium virginicum, in Indiana. Because the Indiana plants grow in a restored wetland, have a cpDNA haplotype previously known only from Missouri, with a morphology similar to Missouri variants, and an herbarium search for additional populations in Indiana found none, it is unclear whether the Indiana population is natural or planted. The presence of a putative sister lineage to H. virginicum thought to exist on the Bruce Peninsula, Ontario, Canada, was not supported after sequencing 36 plants with the sister morphology that grew there along 18 km of beach fens and finding they had H. autumnale sequences. Fine-scale biogeographic patterns of intraspecific sequence variation were found mostly in H. autumnale, with centers of different base site polymorphisms found in northern North America and the Missouri Ozarks. As in a previous study, we found DNA evidence of hybridization between Helenium species in Missouri. We offer hypotheses to explain the biogeography of North American Helenium, focusing on the three species that compose the H. autumnale species complex and suggesting that H. autumnale may be a compilospecies showing incomplete lineage sorting. We encourage exploration of more Helenium species and their conspecific populations in search of fine-scale ITS base site polymorphisms to reveal emerging lineages and resolve the origins and evolutionary implications of these biogeographic patterns.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».