Modular Molecular Weaponry Plays a Key Role in Competition Within an Environmental Vibrio cholerae Population
Notice bibliographique
Résumé
The type VI secretion system (T6SS) operons ofVibrio choleraecontain extraordinarily diverse arrays of toxic effector and cognate immunity genes, which are thought to play an important role in the environmental lifestyle and adaptation of this human pathogen. Through the T6SS, proteinaceous “spears” tipped with antibacterial effectors are injected into adjacent cells, killing those not possessing immunity proteins to these effectors. Here, we investigate the T6SS-mediated dynamics of bacterial competition within a single environmental population ofV. cholerae. We show that numerous members of a North AmericanV. choleraepopulation possess strain-specific repertoires of cytotoxic T6SS effector and immunity genes. Using pairwise competition assays, we demonstrate that the vast majority of T6SS-mediated duels end in stalemates between strains with different T6SS repertoires. However, horizontally acquired effector and immunity genes can significantly alter the outcome of these competitions. Frequently observed horizontal gene transfer events can both increase or reduce competition between distantly related strains by homogenizing or diversifying the T6SS repertoire. Our results also suggest temperature-dependent outcomes in T6SS competition, with environmental isolates faring better against a pathogenic strain under native conditions than under those resembling a host-associated environment. Taken altogether, these interactions produce density-dependent fitness effects and a constant T6SS-mediated arms race in individualV. choleraepopulations, which could ultimately preserve intraspecies diversity. Since T6SSs are widespread, we expect within-population diversity in T6SS repertoires and the resulting competitive dynamics to be a common theme in bacterial species harboring this machinery.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».