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Enregistrement W3162066709 · doi:10.1093/neuonc/noab036

Loss of H3K27me3 in meningiomas

2021· article· en· W3162066709 sur OpenAlexafffund
Farshad Nassiri, Justin Z. Wang, Olivia Singh, Shirin Karimi, Tatyana Dalcourt, Nazanin Ijad, Neda Pirouzmand, Ho‐Keung Ng, Andrea Saladino, Bianca Pollo, Francesco DiMeco, Stephen Yip, Andrew Gao, Kenneth Aldape, Gelareh Zadeh, Karolyn Au, Jill S. Barnholtz‐Sloan, Felix Behling, Wenya Linda Bi, Priscilla K. Brastianos, Nicholas Butowski, Chaya Brodie, Aaron Cohen‐Gadol, Marta Couce, Ian F. Dunn, E. Galanis, Norbert Galldiks, Caterina Giannini, Roland Goldbrunner, Oliver Hanemann, Christel Herold‐Mende, Craig Horbinski, Raymond Y. Huang, Mohsen Javadpour, Michael D. Jenkinson, Timothy J. Kaufmann, Boris Krischek, Sylvia C. Kurz, Daniel H. Lachance, Christian la Fougère, Katrin Lamszus, Ian Lee, Tathiana Malta, Serge Makarenko, Christian Mawrin, Michael McDermott, Christopher P. Millward, Jennifer Moliterno-Gunel, Andrew Morokoff, Houtan Noushmehr, Arie Perry, Laila Poisson, Bianco Pollo, Aditya Ragunathan, David R. Raleigh, Mirjam Renovanz, Franz Ricklefs, Felix Sahm, Antonio Santacroce, Thomas Santarius, Christian Schichor, Nils Ole Schimdt, Jens Schittenhelm, Warren R. Selman, Helen A. Shih, Jim Snyder, Matja Snuderl, Andrew Sloan, Suganth Suppiah, Erik P. Sulman, Ghazaleh Tabatabai, Marcos Tatagiba, Marcos Timmer, Joerg‐Christian Tonn, Andreas von Deimling, Michael A. Vogelbaum, Tobias Walbert, Patrick Y. Wen, Manfred Westphal

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMeningioma and schwannoma management
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity of British ColumbiaUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBrain Tumour Charity
Mots-clésMeningiomaMedicineRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: There is a critical need for objective and reliable biomarkers of outcome in meningiomas beyond WHO classification. Loss of H3K27me3 has been reported as a prognostically unfavorable alteration in meningiomas. We sought to independently evaluate the reproducibility and prognostic value of H3K27me3 loss by immunohistochemistry (IHC) in a multicenter study. METHODS: IHC staining for H3K27me3 and analyses of whole slides from 181 meningiomas across three centers was performed. Staining was analyzed by dichotomization into loss and retained immunoreactivity, and using a 3-tiered scoring system in 151 cases with clear staining. Associations of grouping with outcome were performed using Kaplan-Meier survival estimates. RESULTS: A total of 21 of 151 tumors (13.9%) demonstrated complete loss of H3K27me3 staining in tumor with retained endothelial staining. Overall, loss of H3K27me3 portended a worse outcome with shorter times to recurrence in our cohort, particularly for WHO grade 2 tumors which were enriched in our study. There were no differences in recurrence-free survival (RFS) for WHO grade 3 patients with retained vs loss of H3K27me3. Scoring by a 3-tiered system did not add further insights into the prognostic value of this H3K27me3 loss. Overall, loss of H3K27me3 was not independently associated with RFS after controlling for WHO grade, extent of resection, sex, age, and recurrence status of tumor on multivariable Cox regression analysis. CONCLUSIONS: Loss of H3K27me3 identifies a subset of WHO grade 2 and possibly WHO grade 1 meningiomas with increased recurrence risk. Pooled analyses of a larger cohort of samples with standardized reporting of clinical definitions and staining patterns are warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,580
Score d'incertitude au seuil0,500

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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