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Enregistrement W3162096660 · doi:10.1038/s41597-021-00912-z

Global data on earthworm abundance, biomass, diversity and corresponding environmental properties

2021· article· en· W3162096660 sur OpenAlexafffund
Helen R. P. Phillips, Elizabeth M. Bach, Marie Luise Carolina Bartz, Joanne M. Bennett, Rémy Beugnon, María J.I. Briones, George Gardner Brown, Olga Ferlian, Konstantin B. Gongalsky, Carlos A. Guerra, Birgitta König‐Ries, Julia Krebs, Alberto Orgiazzi, Kelly S. Ramirez, David J. Russell, Benjamin Schwarz, Diana H. Wall, Ulrich Brose, Thibaud Decaëns, Patrick Lavelle, Michel Loreau, Jérôme Mathieu, Christian Mulder, Wim H. van der Putten, Matthias C. Rillig, Madhav P. Thakur, Franciska T. de Vries, David A. Wardle, Christian Ammer, Sabine Ammer, Miwa Arai, Fredrick O. Ayuke, Geoff Baker, Dilmar Baretta, Dietmar Barkusky, Robin Beauséjour, José Camilo Bedano, Klaus Birkhofer, Éric Blanchart, Bernd Blossey, Thomas Bolger, Robert L. Bradley, Michel Brossard, James C. Burtis, Yvan Capowiez, Timothy R. Cavagnaro, Amy Choi, Julia Clause, Daniel Cluzeau, Anja Coors, Felicity Crotty, Jasmine M. Crumsey, Andrea Dávalos, Darío J. Díaz Cosín, Annise M. Dobson, Anahí Domínguez, Andrés Duhour, N.J.M. van Eekeren, Christoph Emmerling, Liliana Falco, Rosa Fernández, Steven J. Fonte, Carlos Fragoso, André L. C. Franco, Abegail Fusilero, А. P. Geraskina, Shaieste Gholami, Grizelle González, Michael J. Gundale, Mónica Gutiérrez López, Branimir K. Hackenberger, Davorka K. Hackenberger, Luis M. Hernández, J. R. Hirth, Takuo Hishi, Andrew R. Holdsworth, Martin Holmstrup, Kristine N. Hopfensperger, Esperanza Huerta Lwanga, Veikko Huhta, Tunsisa T. Hurisso, Basil V. Iannone, M. Iordache, Ulrich Irmler, Mari Ivask, Juan B. Jesús, Jodi Johnson‐Maynard, Monika Joschko, Nobuhiro Kaneko, Radoslava Kanianska, Aidan M. Keith, Maria Kernecker, Armand W. Koné, Yahya Kooch, Sanna Kukkonen, H. Lalthanzara, Daniel R. Lammel, Iurii M. Lebedev, Edith Le Cadre, Noa Kekuewa Lincoln, Danilo López‐Hernández, Scott R. Loss, Raphaël Marichal, Radim Matula, Yukio Minamiya, Jan Hendrik Moos, Gerardo Moreno, Alejandro Morón‐Ríos, Hasegawa Motohiro, Bart Muys, Johan Neirynck, Lindsey Norgrove, Marta Novo, Visa Nuutinen, Victoria Nuzzo, P. Mujeeb Rahman, Johan Pansu, Shishir Paudel, Guenola Pérès, Lorenzo Pérez‐Camacho, Jean‐François Ponge, Jörg Prietzel, И. Б. Рапопорт, Muhammad Imtiaz Rashid, Salvador Rebollo, Miguel Á. Rodrı́guez, Alexander M. Roth, Guillaume Xavier Rousseau, Anna Rożen, Ehsan Sayad, Loes van Schaik, Bryant Scharenbroch, Michael Schirrmann, Olaf Schmidt, Boris Schröder, Julia Seeber, Maxim Shashkov, Jaswinder Singh, Sandy M. Smith, Michael Steinwandter, Katalin Szlávecz, José Antonio Talavera, Dolores Trigo, Jiro Tsukamoto, Sheila A Uribe-López, Anne W. de Valença, Iñigo Virto, Adrian Wackett, Matthew Warren, Emily Webster, Nathaniel H. Wehr, Joann K. Whalen, Michael Wironen, Volkmar Wolters, Pengfei Wu, И. В. Зенкова, Weixin Zhang, Erin K. Cameron, Nico Eisenhauer

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInvertebrate Taxonomy and Ecology
Établissements canadiensCanada Research ChairsNatural Resources CanadaUniversity of TorontoUniversité de SherbrookeMcGill UniversitySaint Mary's University
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDeutsches Zentrum für integrative Biodiversitätsforschung Halle-Jena-LeipzigBundesministerium für Bildung und ForschungAcademy of FinlandRussian Foundation for Basic ResearchAgence Nationale de la RechercheDeutsche ForschungsgemeinschaftNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEuropean Commission
Mots-clésEarthwormAbundance (ecology)Biomass (ecology)Diversity (politics)EcologyEnvironmental scienceMacroecologyBiodiversityBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Earthworms are an important soil taxon as ecosystem engineers, providing a variety of crucial ecosystem functions and services. Little is known about their diversity and distribution at large spatial scales, despite the availability of considerable amounts of local-scale data. Earthworm diversity data, obtained from the primary literature or provided directly by authors, were collated with information on site locations, including coordinates, habitat cover, and soil properties. Datasets were required, at a minimum, to include abundance or biomass of earthworms at a site. Where possible, site-level species lists were included, as well as the abundance and biomass of individual species and ecological groups. This global dataset contains 10,840 sites, with 184 species, from 60 countries and all continents except Antarctica. The data were obtained from 182 published articles, published between 1973 and 2017, and 17 unpublished datasets. Amalgamating data into a single global database will assist researchers in investigating and answering a wide variety of pressing questions, for example, jointly assessing aboveground and belowground biodiversity distributions and drivers of biodiversity change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,061

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0190,032
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0180,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,099
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,122 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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