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Enregistrement W3162122341 · doi:10.1002/cpz1.135

SHIRPA as a Neurological Screening Battery in Mice

2021· article· en· W3162122341 sur OpenAlexaff
Robert Lalonde, Mohammed Filali, C. Strazielle

Notice bibliographique

RevueCurrent Protocols · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésForelimbReflexCerebellar DegenerationNeuroscienceCerebellumMotor coordinationPsychologyMedicinePhysical medicine and rehabilitation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The SmithKline, Harwell, Imperial College, Royal Hospital, Phenotype Assessment (SHIRPA) is a rapid battery of tests comprising 42 measurements of motor activity, coordination, postural control, muscle tone, autonomic functions, and emotional reactivity, as well as reflexes dependent on visual, auditory, and tactile modalities. Individual scores in SHIRPA are sensitive in detecting phenotypes of several experimental models of neural disease, especially cerebellar degeneration and Alzheimer disease, and combined subscores have been useful in estimating the impact of vascular anomalies and exposure to infectious agents. In cerebellar degeneration, weak forelimb grip, impaired wire maneuver and air righting, and negative geotaxis appear as prevalent features. Most of the measures in the battery are susceptible to change after gene modifications or physiological alterations. SHIRPA can be used both in adult mice and mice in the preweaning period to screen for sensorimotor function and emotional reactivity, not selective attention or memory. © 2021 Wiley Periodicals LLC Basic Protocol: Step-by-step procedure for SHIRPA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,149

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0070,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0450,026

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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