Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Colorectal cancer is the most common gastrointestinal carcinoma in western countries. Prognosis of metastatic colorectal cancer has improved in the last decades, but the disease continues to carry an adverse outcome in most cases. An improved understanding of molecular pathogenesis has provided incremental benefits in survival outcomes with the introduction of targeted therapies for specific sub-types and gives hope for further improvements. MATERIALS AND METHODS: Publicly available data from genomic series of colorectal cancer published by the TCGA were analyzed with the aim of characterizing the sub-set of colorectal cancers carrying amplifications of chromosome 20q11.21, compared with cancers with no amplifications in this locus. Associations of 20q11.21-amplified cancers with other molecular lesions commonly observed in colorectal cancer were explored. mRNA expression of genes from the locus in amplified cases was analyzed. An exploratory survival analysis was also performed. RESULTS: Amplifications of genes at chromosome arm 20q are observed in 7% to 9% of colorectal cancers, representing the most commonly amplified loci in this type of cancer. The 20q11.21 presents the highest amplification rate in the 20q arm. 20q11.21 amplified cancers display concomitant mutations in the KRAS pathway and SMAD4 less often than non-amplified cancers. Mutations in DNA repair genes are also less often encountered in 20q11.21 amplified colorectal cancers than non-amplified ones. CONCLUSION: Amplification of genes at locus 20q11.21, representing the most frequently amplified locus in colorectal cancers, is associated with specific molecular characteristics and may have therapeutic implications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».