Anchored Phylogenomics, Evolution and Systematics of Elateridae: Are All Bioluminescent Elateroidea Derived Click Beetles?
Notice bibliographique
Résumé
Click-beetles (Coleoptera: Elateridae) are an abundant, diverse, and economically important beetle family that includes bioluminescent species. To date, molecular phylogenies have sampled relatively few taxa and genes, incompletely resolving subfamily level relationships. We present a novel probe set for anchored hybrid enrichment of 2260 single-copy orthologous genes in Elateroidea. Using these probes, we undertook the largest phylogenomic study of Elateroidea to date (99 Elateroidea, including 86 Elateridae, plus 5 non-elateroid outgroups). We sequenced specimens from 88 taxa to test the monophyly of families, subfamilies and tribes. Maximum likelihood and coalescent phylogenetic analyses produced well-resolved topologies. Notably, the included non-elaterid bioluminescent families (Lampyridae + Phengodidae + Rhagophthalmidae) form a clade within the otherwise monophyletic Elateridae, and Sinopyrophoridae may not warrant recognition as a family. All analyses recovered the elaterid subfamilies Elaterinae, Agrypninae, Cardiophorinae, Negastriinae, Pityobiinae, and Tetralobinae as monophyletic. Our results were conflicting on whether the hypnoidines are sister to Dendrometrinae or Cardiophorinae + Negastriinae. Moreover, we show that fossils with the eucnemid-type frons and elongate cylindrical shape may belong to Eucnemidae, Elateridae: Thylacosterninae, ancestral hard-bodied cantharoids or related extinct groups. Proposed taxonomic changes include recognition of Plastocerini as a tribe in Dendrometrinae and Hypnoidinae stat. nov. as a subfamily within Elateridae.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».