HelR is a helicase-like protein that protects RNA polymerase from rifamycin antibiotics
Notice bibliographique
Résumé
Summary Rifamycin antibiotics such as rifampin are widely used for the management of tuberculosis and other bacterial infections. These drugs inhibit prokaryotic RNA polymerase (RNAP) by preventing elongation of mRNA resulting in cell death. Rifamycin resistance in the clinic is manifested primarily through amino acid substitutions in RNAP that decrease target affinity for the antibiotics. In contrast, environmental bacteria possess a wide variety of highly specific rifamycin enzyme-mediated resistance mechanisms that modify and inactivate the antibiotics by glycosylation, phosphorylation, ADP-ribosylation, or hydroxylation. Expression of rifamycin resistance is controlled by a common 19bp cis -acting rifamycin associated element (RAE) upstream of inactivating genes. Guided by the presence of RAE sequences, we identify an unprecedented ATP-dependent mechanism of rifamycin resistance that acts not by antibiotic inactivation but by protecting the RNAP target. We show that Streptomyces venezuelae encodes a helicase-like protein, HelR, which confers broad spectrum rifamycin resistance. Furthermore, HelR is essential for promoting rifamycin tolerance at inhibitory concentrations, enabling bacterial evasion of the toxic properties of these antibiotics. HelR forms a complex with RNAP in vivo and rescues transcription inhibition by rifampin in vitro. We synthesized a rifamycin photoprobe and demonstrated that HelR directly displaces rifamycins from RNAP. HelR-encoding genes associated with RAEs are broadly distributed in actinobacteria, including many opportunistic Mycobacterial pathogens, which cannot currently be treated with rifamycins. This first report of an RNAP protection protein conferring antibiotic resistance and offers guidance for developing new rifamycin antibiotics that can avoid this mechanism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».