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Enregistrement W3163175221 · doi:10.1016/j.crmeth.2021.100011

Rapid and accurate agglutination-based testing for SARS-CoV-2 antibodies

2021· article· en· W3163175221 sur OpenAlexafffund
Sally Esmail, Michael J. Knauer, Husam Abdoh, Courtney Voss, Benjamin Chin‐Yee, P.J. Stogios, Almagul Seitova, Ashley Hutchinson, Farhad Yusifov, T. Skarina, E. Evdokimova, Suzanne Ackloo, Lori E. Lowes, Benjamin D. Hedley, Vipin Bhayana, Ian Chin‐Yee, Shawn S.‐C. Li

Notice bibliographique

RevueCell Reports Methods · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumUniversity of TorontoLondon Health Sciences CentreWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Research Foundation
Mots-clésVirologyAntibodyAgglutination (biology)SerologyDirect agglutination testLatex fixation testSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)NeutralizationVirusBiologyMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)ImmunologyInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have developed a rapid, accurate, and cost-effective serologic test for SARS-CoV-2 virus, which caused the COVID-19 pandemic, on the basis of antibody-dependent agglutination of antigen-coated latex particles. When validated using plasma samples that are positive or negative for SARS-CoV-2, the agglutination assay detected antibodies against the receptor-binding domain of the spike (S-RBD) or the nucleocapsid protein of SARS-CoV-2 with 100% specificity and ∼98% sensitivity. Furthermore, we found that the strength of the S-RBD antibody response measured by the agglutination assay correlated with the efficiency of the plasma in blocking RBD binding to the angiotensin-converting enzyme 2 in a surrogate neutralization assay, suggesting that the agglutination assay might be used to identify individuals with virus-neutralizing antibodies. Intriguingly, we found that >92% of patients had detectable antibodies on the day of a positive viral RNA test, suggesting that the agglutination antibody test might complement RNA testing for the diagnosis of SARS-CoV-2 infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,148
Tête enseignante GPT0,453
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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