MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3163407491 · doi:10.1099/ijsem.0.004786

Description of Clavibacter zhangzhiyongii sp. nov., a phytopathogenic actinobacterium isolated from barley seeds, causing leaf brown spot and decline

2021· article· en· W3163407491 sur OpenAlex
Qian Tian, Jiacheng Chuan, Xianchao Sun, Aiguo Zhou, Li Wang, Jixing Zou, Wenjun Zhao, Xiang Li

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueINTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySubspeciesBotanyPhylogenetic treeClavibacter michiganensisGenus16S ribosomal RNAMicrobiologyBacteriaZoologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clavibacter michiganensis is a Gram-stain-positive bacterium with eight subspecies, five of which have been redefined as different species on the basis of their genome sequence data. On the basis of the results of phylogenetic analysis of dnaA gene sequences, strains of members of the genus Clavibacter isolated from barley have been grouped in a separate clade from other species and subspecies of the genus Clavibacter . In this study, the biochemical, physiological, fatty acids and genetic characteristics of strains DM1 T and DM3, which represented the barley isolates, were examined. On the basis of results from multi-locus sequence typing and other biochemical and physiological features, including colony colour, carbon source utilisation and enzyme activities, DM1 T and DM3 are categorically differentiated from the aforementioned eight species and subspecies of the genus Clavibacter . Moreover, the results of genomic analysis reveal that the DNA G+C contents of DM1 T and DM3 are 73.7 and 73.5 %, respectively, and the average nucleotide identity (ANI) values between DM1 T and DM3 and other species and subspecies range from 90.4 to 92.0 %. The ANI value between DM1 T and DM3 is 98.0 %. These results indicate that DM1 T and DM3 are distinct from other known species and subspecies of the genus Clavibacter . Therefore, we propose a novel species, C. zhangzhiyongii , with DM1 T (=CFCC 16553 T =LMG 31970 T ) as the type strain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,965
Score d'incertitude au seuil0,334

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle