MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3163477949 · doi:10.1093/ibd/izab123

Serum Analyte Profiles Associated With Crohn’s Disease and Disease Location

2021· article· en· W3163477949 sur OpenAlexafffund
Gabrielle Boucher, Alexandre Paradis, Geneviève Chabot‐Roy, Lise Coderre, Erin E. Hillhouse, Alain Bitton, Christine Des Rosiers, Megan K. Levings, L. Philip Schumm, Mark Lazarev, Steven R. Brant, Richard H. Duerr, Dermot McGovern, Mark S. Silverberg, Judy H. Cho, Sylvie Lesage, John D. Rioux, Guy Charron, Anik Forest, Philippe Goyette, Sabine Ivinson, Lawrence Joseph, Rita Kohen, Jean Lachaine, Julie Thompson‐Legault, Luc Vachon, Sophie Veilleux, Brian White-Guay, Manisha Bajpai, Sondra Birch, Krzysztof Borowski, Gregory J. Botwin, Wei Chen, Roberto Cordero, Justin Côté-Daigneault, Mark J. Daly, Lisa W. Datta, Melissa Filice, Philip Fleshner, Kyle Gettler, Mamta Giri, Ke Hao, Talin Haritunians, Yuval Itan, Elyse Johnston, Liza Konnikova, Carol Landers, Dalin Li, Emebet Mengesha, Miriam Mérad, Vessela Miladinova, Shadi Nayeri, Siobhan Proksell, Raquel Milgrom, Klaudia Rymaszewski, Ksenija Sabic, Bruce E. Sands, Marc Schwartz, Claire L. Simpson, Joanne M. Stempak, Christine Stevens, Stephan R. Targan, Ramnik J. Xavier

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensBC Children's HospitalMcGill UniversityUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-RosemontMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanada Foundation for InnovationCanada Research ChairsCrohn's and Colitis Foundation
Mots-clésAnalyteInflammatory bowel diseaseImmune systemDiseaseCrohn's diseaseChemokineImmunologyCXCL1MedicineCytokineGastroenterologyInternal medicineBiologyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Crohn's disease (CD) can affect any segment of the digestive tract but is most often localized in the ileal, ileocolonic, and colorectal regions of the intestines. It is believed that the chronic inflammation in CD is a result of an imbalance between the epithelial barrier, the immune system, and the intestinal microbiota. The aim of the study was to identify circulating markers associated with CD and/or disease location in CD patients. METHODS: We tested 49 cytokines, chemokines, and growth factors in serum samples from 300 patients with CD and 300 controls. After quality control, analyte levels were tested for association with CD and disease location. RESULTS: We identified 13 analytes that were higher in CD patients relative to healthy controls and that remained significant after conservative Bonferroni correction (P < 0.0015). In particular, CXCL9, CXCL1, and interleukin IL-6 had the greatest effect and were highly significant (P < 5 × 10-7). We also identified 9 analytes that were associated with disease location, with VEGF, IL-12p70, and IL-6 being elevated in patients with colorectal disease (P < 3 × 10-4). CONCLUSIONS: Multiple serum analytes are elevated in CD. These implicate the involvement of multiple cell types from the immune, epithelial, and endothelial systems, suggesting that circulating analytes reflect the inflammatory processes that are ongoing within the gut. Moreover, the identification of distinct profiles according to disease location supports the existence of a biological difference between ileal and colonic CD, consistent with previous genetic and clinical observations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInflammatory Bowel DiseasesMême sujetInflammatory Bowel DiseaseTravaux en français237 207