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Enregistrement W3163734014

THE IMPORTANCE OF OSMO-MIXOTROPHY IN THE NUTRITION OF THE DIATOM THALASSIOSIRA OCEANICA UNDER IRON LIMITATION

2018· article· en· W3163734014 sur OpenAlexaboutno aff
Afrah Alothman

Notice bibliographique

RevueKing Abdullah University of Science and Technology Repository (King Abdullah University of Science and Technology) · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiatomBiologyEcologyFishery
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Importance of Osmo-mixotrophy in the Nutrition of the Diatom ThalassiosiraoceanicaUnder Iron Limitation\nAfrah Alothman, MSc thesis, Biology Department at Dalhousie University, Halifax, NS, Canada (July 2017). \n© Copyright by Afrah Alothman, 2017\nIntroduction:\nIn general, photosynthetic carbon fixation by phytoplankton contributes significantly to carbon sequestration and storage in the deep ocean through the biological pump (Martin, 1990). Martin (1990) put forward the “iron hypothesis” that the rapid changes in CO2concentration in the atmosphere observed on geological timescales could be due to low phytoplankton productivity caused by iron deficiency in the HNLC regions. Diatoms such as Thalassiosira oceanica arevery plastic in their physiology and can acclimate to nutrient-limited conditions by down-regulating specific physiological processes in order to minimize demands for certain elements or nutrients, including iron (Lommer et al., 2012 & Chappell et al, 2015). This thesis aims to study the ‘osmo-mixotrophy’ defined as the utilization of organic substrates available in the environment(labile organic substrates) (Selosseet al, 2016) by autotrophic organism T. oceanica under iron replete and iron limited condition.\nMethod:\nThe isotope labelling experiments were designed to measure the uptake and the assimilation of inorganic (CO2) and organic carbon and nitrogen (Urea) by cells grown in iron-replete and iron-limited conditions incubated with either15N-nitrateor13C/15N-ureaas inorganic nitrogen and organic nitrogen source, respectively. Throughout the growth period, a series of physiological measurements were conducted (Table 1), and when the cells reach the exponential growth phase, cultures were harvested for incubating the isotope labelling samples(ILE).\nResults:\n1- Thalassiosira oceanicacan grow osmo-mixotrophically \n(Figure 2, Figure 3).\n2- Urea as an organic nitrogen and carbon source supported higher biomass than nitrate under iron limited condition(Figure 4)\n3- Both C and N atoms from urea are assimilated by T. oceanica(Table 2).\nConclusion\nIsotope labeling experiments with 13C-HCO3onate,15N-nitrate, and dual labeled 13C/15N urea showed that both N and C from the urea molecule were assimilated into cellular biomass by T. oceanica, though C uptake was at a lower rate than photosynthetic CO2fixation; the C/N uptake ratio was 0.15, which is less than the 0.5 C/N stoichiometric ratio of the urea molecule. In addition, the C uptake from urea under iron-limited and iron-replete conditions contributed from 5% ± 3.72to 11% ± 1.71 of total carbon assimilation. This was proportional to the fraction of urea-C relative to the total pool of dissolved carbon in the medium. In addition, the batch culture experiments suggested that, at equal dissolved N concentrations, urea supported a higher biomass than nitrate in iron-limited cultures. There was no significant difference in photosynthetic carbon fixation and nutrient uptake between the iron-limited and the iron-replete cultures.\nReferences:\nChappell, P. D., Whitney, L. P., Wallace, J. R., Darer, A. I., Jean-Charles, S., & Jenkins, B. D. (2015). Genetic indicators of iron limitation in wild populations of Thalassiosira oceanicafrom the northeast Pacific Ocean. The ISME journal, 9(3), 592-602.\nLommer, M., Specht, M., Roy, A. S., Kraemer, L., Andreson, R.,Gutowska, M. A., &LaRoche, J. (2012). Genome and low-iron response of an oceanic diatom adapted to chronic iron limitation. Genome biology, 13(7), R66.\nMartin, J. H. (1990). Glacial‐interglacial CO2 change: The iron hypothesis. Paleoceanography,5(1), 1-13.‏\nSelosse, M. A., Charpin, M., & Not, F. (2016). Mixotrophyeverywhere on land and in water: the grand écarthypothesis. Ecology Letters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,163
Écart entre enseignants0,158 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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Résumé présentoui

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