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Enregistrement W3163896268 · doi:10.1101/2021.05.10.21256855

<i>Plasmodium</i> infection induces cross-reactive antibodies to carbohydrate epitopes on the SARS-CoV-2 Spike protein

2021· preprint· en· W3163896268 sur OpenAlexfundno aff
Sarah Lapidus, Feimei Liu, Arnau Casanovas‐Massana, Yile Dai, John D. Huck, Carolina Lucas, Jon Klein, Renata B. Filler, Madison S. Strine, Mouhamad Sy, Awa B. Dème, Aïda Sadikh Badiane, Baba Dièye, Ibrahima Ndiaye, Younous Diedhiou, Amadou Moctar Mbaye, Cheikh Tidiane Diagne, Inès Vigan-Womas, Alassane Mbengue, Bacary Djilocalisse Sadio, Moussa Moïse Diagne, Adam J. Moore, Khadidiatou Mangou, Fatoumata Diallo, Seynabou D. Sene, Mariama N. Pouye, Rokhaya Faye, Babacar Diouf, Nívison Nery, Federico Costa, Mitermayer Galvão dos Reis, M. Catherine Muenker, Daniel Z. Hodson, Yannick Mbarga, Ben Z. Katz, Jason R. Andrews, Melissa Campbell, Ariktha Srivathsan, Kathy Kamath, Elisabeth Baum, Ousmane Faye, Amadou Alpha Sall, Juan Carlos Quintero Vélez, Michael Cappello, Michael D. Wilson, Choukri Ben-Mamoun, Anyirékun Fabrice Somé, Roch K. Dabiré, Carole Else Eboumbou Moukoko, Jean Bosco Ouédraogo, Yap Boum, John Shon, Daouda Ndiaye, Adam V. Wisnewski, Sunil Parikh, Akiko Iwasaki, Craig B. Wilen, Albert I. Ko, Aaron M. Ring, Amy K. Bei

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFogarty International CenterUniversité Cheikh Anta Diop de DakarLudwig Family FoundationAgence Universitaire de la FrancophonieHarvard T.H. Chan School of Public HealthNational Institutes of HealthYale University
Mots-clésAntibodyEpitopeVirologyMalariaSialic acidSpike (software development)PandemicImmunologySerologyBiologyPopulationSpike ProteinCerebral MalariaImmunityPlasmodium falciparumDiseaseCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MedicineImmune systemInfectious disease (medical specialty)BiochemistryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Individuals with acute malaria infection generated high levels of antibodies that cross-react with the SARS-CoV-2 Spike protein. Cross-reactive antibodies specifically recognized the sialic acid moiety on N-linked glycans of the Spike protein and do not neutralize in vitro SARS-CoV-2. Sero-surveillance is critical for monitoring and projecting disease burden and risk during the pandemic; however, routine use of Spike protein-based assays may overestimate SARS-CoV-2 exposure and population-level immunity in malaria-endemic countries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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