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Enregistrement W3164016997 · doi:10.3389/frma.2021.683212

Profiling COVID-19 Genetic Research: A Data-Driven Study Utilizing Intelligent Bibliometrics

2021· article· en· W3164016997 sur OpenAlexaboutno aff
Mengjia Wu, Yi Zhang, Mark Grosser, Steven Tipper, Deon J. Venter, Hua Lin, Jie Lü

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Research Metrics and Analytics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAustralian Research CouncilUniversity of Technology SydneyUniversity of Sydney
Mots-clésPandemicBibliometricsPublic healthBiologyHuman geneticsDiseasePolitical scienceEvolutionary biologyGeneticsCoronavirus disease 2019 (COVID-19)GeneInfectious disease (medical specialty)MedicineLibrary scienceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The COVID-19 pandemic constitutes an ongoing worldwide threat to human society and has caused massive impacts on global public health, the economy and the political landscape. The key to gaining control of the disease lies in understanding the genetics of SARS-CoV-2 and the disease spectrum that follows infection. This study leverages traditional and intelligent bibliometric methods to conduct a multi-dimensional analysis on 5,632 COVID-19 genetic research papers, revealing that 1) the key players include research institutions from the United States, China, Britain and Canada; 2) research topics predominantly focus on virus infection mechanisms, virus testing, gene expression related to the immune reactions and patient clinical manifestation; 3) studies originated from the comparison of SARS-CoV-2 to previous human coronaviruses, following which research directions diverge into the analysis of virus molecular structure and genetics, the human immune response, vaccine development and gene expression related to immune responses; and 4) genes that are frequently highlighted includeACE2,IL6,TMPRSS2, andTNF. Emerging genes to the COVID-19 consist ofFURIN,CXCL10,OAS1,OAS2,OAS3, andISG15. This study demonstrates that our suite of novel bibliometric tools could help biomedical researchers follow this rapidly growing field and provide substantial evidence for policymakers’ decision-making on science policy and public health administration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,043
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Bibliométrie
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,035

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,043
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0770,106
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,610
Tête enseignante GPT0,558
Écart entre enseignants0,052 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineÉvaluation
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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