Antimicrobial susceptibility profiles of invasive isolates of anaerobic bacteria from a large Canadian reference laboratory: 2012–2019
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Anaerobic bacteria can cause severe and life threatening infections. Susceptibility data are relatively limited on anaerobic organisms despite the clinical importance in guiding empiric treatment of infections. To determine antimicrobial susceptibility profiles of clinically significant anaerobic bacteria, isolates obtained from sterile sites submitted to Public Health Ontario Laboratory (2012-2019) were included in this study (N = 5712). Cefoxitin, clindamycin, metronidazole, meropenem, penicillin and piperacillin-tazobactam were tested using the gradient strip method with MICs interpreted based on Clinical and Laboratory Standards Institute guidelines. Bacteroides spp. (N = 958; 16.7%), Clostridium spp. (N = 798; 14.0%), Cutibacterium spp. (N =659; 11.5%) and Actinomyces spp. (N = 551; 7.0%) were the most commonly isolated genera. Bacteroides fragilis isolates were susceptible to cefoxitin (88.4%), clindamycin (68.4%), metronidazole (96.0%), meropenem (99.0%) and piperacillin-tazobactam (98.4%). Other Bacteroides spp. showed reduced susceptibility to several antimicrobials. Clostridium spp. isolates were susceptible to penicillin (69.7%), clindamycin (69.7%) and cefoxitin (76.3%); C. perfringens and C. ramosum showed distinct susceptibility profiles. Susceptibility rates among anaerobes remained relatively unchanged over 8 years with a few exceptions: C. perfringens susceptibility to clindamycin decreased from 91.3% to 60% (p = 0.03); Clostridium spp. susceptibility to penicillin similarly decreased from 82.1% to 65.9% (p = 0.03); Eggerthella spp. susceptibility to piperacillin-tazobactam decreased from 100% to 24.3% (p < 0.001); B. fragilis group susceptibility to cefoxitin decreased from 70.4% to 48.2% (p = 0.05); and Parabacteroides spp. susceptibility to piperacillin-tazobactam decreased from 100% to 25% (p = 0.01). Our findings underscore the need for ongoing surveillance and periodic monitoring of antimicrobial resistance in order to guide empiric therapy.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle