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Enregistrement W3164143272 · doi:10.1038/s41598-021-90365-6

Genetics of symptom remission in outpatients with COVID-19

2021· article· en· W3164143272 sur OpenAlexafffund
Marie‐Pierre Dubé, Audrey Lemaçon, Amina Barhdadi, L Perreault, Essaïd Oussaïd, Géraldine Asselin, Sylvie Provost, Maxine Sun, Johanna Sandoval, Marc‐André Legault, Ian Mongrain, Anick Dubois, Diane Valois, Emma Dedelis, Jennifer Lousky, Julie Choi, Elisabeth Goulet, Christiane Savard, Lea-Mei Chicoine, Mariève Cossette, Malorie Chabot-Blanchet, Marie-Claude Guertin, Simon de Denus, Nadia Bouabdallaoui, R. Marchand, Zohar Bassevitch, Anna Nozza, Daniel Gaudet, Philippe L. L’Allier, Julie Hussin, Guy Boivin, David Busseuil, Jean‐Claude Tardif

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLong-Term Effects of COVID-19
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de MontréalUniversité LavalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesUniversité de MontréalFonds de Recherche du Québec - SantéBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)2019-20 coronavirus outbreakSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)MEDLINEMedicineBioinformaticsBiologyVirologyInternal medicineDiseaseOutbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We conducted a genome-wide association study of time to remission of COVID-19 symptoms in 1723 outpatients with at least one risk factor for disease severity from the COLCORONA clinical trial. We found a significant association at 5p13.3 (rs1173773; P = 4.94 × 10 –8 ) near the natriuretic peptide receptor 3 gene ( NPR3 ). By day 15 of the study, 44%, 54% and 59% of participants with 0, 1, or 2 copies of the effect allele respectively, had symptom remission. In 851 participants not treated with colchicine (placebo), there was a significant association at 9q33.1 (rs62575331; P = 2.95 × 10 –8 ) in interaction with colchicine ( P = 1.19 × 10 –5 ) without impact on risk of hospitalisations, highlighting a possibly shared mechanistic pathway. By day 15 of the study, 46%, 62% and 64% of those with 0, 1, or 2 copies of the effect allele respectively, had symptom remission. The findings need to be replicated and could contribute to the biological understanding of COVID-19 symptom remission.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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