The Plot Thickens: Haploid and Triploid-Like Thalli, Hybridization, and Biased Mating Type Ratios in Letharia
Notice bibliographique
Résumé
The study of the reproductive biology of lichen fungal symbionts has been traditionally challenging due to their complex lifestyles. Against the common belief of haploidy, a recent genomic study found a triploid-like signal in Letharia . Here, we infer the genome organization and reproduction in Letharia by analyzing genomic data from a pure culture and from thalli, and performing a PCR survey of the MAT locus in natural populations. We found that the read count variation in the four Letharia specimens, including the pure culture derived from a single sexual spore of L. lupina , is consistent with haploidy. By contrast, the L. lupina read counts from a thallus' metagenome are triploid-like. Characterization of the mating-type locus revealed a conserved heterothallic configuration across the genus, along with auxiliary genes that we identified. We found that the mating-type distributions are balanced in North America for L. vulpina and L. lupina , suggesting widespread sexual reproduction, but highly skewed in Europe for L. vulpina , consistent with predominant asexuality. Taken together, we propose that Letharia fungi are heterothallic and typically haploid, and provide evidence that triploid-like individuals are hybrids between L. lupina and an unknown Letharia lineage, reconciling classic systematic and genetic studies with recent genomic observations.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».