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Enregistrement W3164246322 · doi:10.3899/jrheum.210106

The COVID-19 Vaccine Landscape: What a Rheumatologist Needs to Know

2021· editorial· en· W3164246322 sur OpenAlexvenueno aff
Katie Bechman, Mrinalini Dey, Mark Yates, Marwan Bukhari, Kevin Winthrop, James Galloway

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2021
Typeeditorial
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésVirologyMessenger RNACoronavirusViral entryViral vectorSpike (software development)MedicineDNA vaccinationVector (molecular biology)GeneVirusRNAViral replicationBiologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)GeneticsRecombinant DNAInfectious disease (medical specialty)Computer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In January 2020, a new strain of coronavirus was described. Less than 3 months later, a pandemic was declared. Within 9 months, the first vaccine received emergency authorization. Keeping up with the infodemic has been arduous, due to the unparalleled pace of scientific study. Here, we summarize the work toward a vaccine, framing the progress in a manner relevant to physicians managing patients on immune modulation. SARS-CoV-2 is a positive sense single-stranded RNA virus. Like other coronaviruses, it has 4 structural components: spike, envelope, membrane, and nucleocapsid proteins. The spike protein facilitates binding and fusion to host cells, making it an attractive vaccine antigen. There have been 3 approaches in developing a SARS-CoV-2 vaccine: (1) attaching the spike protein to a nonreplicating viral vector; (2) using messenger RNA (mRNA) technology to induce host spike protein synthesis; and (3) delivery of spike protein with an adjuvant. The AstraZeneca vaccine takes the first approach, using a replication-deficient chimpanzee adenovirus vector containing the spike gene. Once inside a cell, the vector uses the cell’s existing molecular machinery to transcribe DNA to mRNA and produce the spike protein. Replication-deficient viral vector-based vaccines have been used safely in immunosuppressed individuals. The second approach is employed by Pfizer-BioNTech and Moderna, who have produced the first vaccines to be licensed using synthetic mRNA technology. mRNA is within a lipid droplet, protecting it from enzymatic breakdown and enabling cell entry. The mRNA strand induces spike protein synthesis without entering the cell’s nucleus or affecting genetic material. Finally, Novovax have developed a protein-based vaccine, currently in submission for licensing. Manufactured from moth cells infected with baculovirus, it contains a modified spike gene, producing the spike protein. This is harvested and assembled into nanoparticles. It is combined with an immunity-priming adjuvant (matrix M1), enhancing vaccine response. The spike protein is … Address correspondence to Dr. K. Bechman, Centre for Rheumatic Disease, Weston Education Centre, King’s College London, London SE5 9RJ, UK. Email: katie.bechman{at}kcl.ac.uk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,059

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0080,015
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0130,021
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0180,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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