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Enregistrement W3164272096 · doi:10.1002/jev2.12093

Urinary extracellular vesicles: A position paper by the Urine Task Force of the International Society for Extracellular Vesicles

2021· article· en· W3164272096 sur OpenAlexaff
Uta Erdbrügger, Charles J. Blijdorp, Irene V. Bijnsdorp, Francesc E. Borràs, Dylan Burger, Benedetta Bussolati, James Brian Byrd, Aled Clayton, James W. Dear, Juan Manuel Falcón‐Pérez, Cristina Grange, Andrew F. Hill, Harry Holthöfer, Ewout J. Hoorn, Guido Jenster, Connie R. Jiménez, Kerstin Junker, John B. Klein, Mark A. Knepper, Erik H. Koritzinsky, James M. Luther, Metka Lenassi, Janne Leivo, Inge Mertens, Luca Musante, Eline Oeyen, Maija Puhka, Martin E. van Royen, Catherine Sánchez, Carolina Soekmadji, Visith Thongboonkerd, Volkert van Steijn, Gerald W. Verhaegh, Jason Webber, Kenneth W. Witwer, Peter S.T. Yuen, Lei Zheng, Alicia Llorente, Elena S. Martens‐Uzunova

Notice bibliographique

RevueJournal of Extracellular Vesicles · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteHelse Sør-Øst RHFNorges ForskningsrådNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthCancer Research WalesNierstichtingKWF KankerbestrijdingKreftforeningen
Mots-clésExtracellular vesiclesStandardizationTask forceMedicineEngineering ethicsComputer sciencePolitical scienceBiologyEngineeringCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Urine is commonly used for clinical diagnosis and biomedical research. The discovery of extracellular vesicles (EV) in urine opened a new fast‐growing scientific field. In the last decade urinary extracellular vesicles (uEVs) were shown to mirror molecular processes as well as physiological and pathological conditions in kidney, urothelial and prostate tissue. Therefore, several methods to isolate and characterize uEVs have been developed. However, methodological aspects of EV separation and analysis, including normalization of results, need further optimization and standardization to foster scientific advances in uEV research and a subsequent successful translation into clinical practice. This position paper is written by the Urine Task Force of the Rigor and Standardization Subcommittee of ISEV consisting of nephrologists, urologists, cardiologists and biologists with active experience in uEV research. Our aim is to present the state of the art and identify challenges and gaps in current uEV‐based analyses for clinical applications. Finally, recommendations for improved rigor, reproducibility and interoperability in uEV research are provided in order to facilitate advances in the field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,037
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,024
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,198

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0370,024
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0110,005
Science ouverte0,0050,008
Intégrité de la recherche0,0150,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations397
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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