MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3164471935 · doi:10.1016/j.jgar.2021.04.014

Molecular characteristics and antimicrobial susceptibility of penicillinase-producing Neisseria gonorrhoeae isolates in Fukuoka, Japan, 1996–2018

2021· article· en· W3164471935 sur OpenAlexaboutno aff
Masatoshi Tanaka, Ryusaburo Furuya, Intetsu Kobayashi, Akira Ohno, Izumo Kanesaka

Notice bibliographique

RevueJournal of Global Antimicrobial Resistance · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlasmidNeisseria gonorrhoeaeMicrobiologyBiologyCefiximeMultilocus sequence typingPenicillinAgar dilutionTypingVirologyCephalosporinAntimicrobialAntibioticsGenotypeGeneticsGeneMinimum inhibitory concentration

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this study was to investigate the molecular characteristics and antimicrobial susceptibility of penicillinase-producing Neisseria gonorrhoeae (PPNG) isolates collected in Fukuoka, Japan, from 1996–2018. Antimicrobial susceptibility to seven antibiotics was determined by the agar dilution method. Molecular characteristics were determined by Sanger sequencing of the blaTEM allele, plasmid typing and N. gonorrhoeae multiantigen sequence typing (NG-MAST). Furthermore, full sequences of the penA gene, encoding penicillin-binding protein 2 (PBP2), of PPNG isolates with reduced susceptibility to cefixime were analysed. Among 50 PPNG isolates, 17 and 33 were collected during 1996–2006 and 2007–2018, respectively. In 1996–2006, blaTEM-1 in African plasmid was most frequent (64.7%), followed by blaTEM-1 in Asian plasmid (29.4%) and blaTEM-135 in Toronto/Rio plasmid (5.9%). In 2007–2018, blaTEM-135 in Toronto/Rio plasmid was predominant (54.5%), followed by blaTEM-1 in African plasmid (36.4%) and blaTEM-135 in Asian plasmid (6.1%). Among isolates with the blaTEM-135-carrying Toronto/Rio plasmid in 2007–2018, a novel genogroup G15576 was predominant (66.7%). Isolates with the TEM-135 β-lactamase were more resistant to ciprofloxacin but were more susceptible to ceftriaxone and tetracycline than isolates with TEM-1. Seven PPNG isolates less susceptible to cefixime possessed the plasmidic blaTEM-1 allele and had mosaic or non-mosaic alterations within PBP2. The proportion of PPNG with the blaTEM135-carrying Toronto/Rio plasmid increased during the last 12 years. The increase in PPNG carrying the blaTEM-135 allele is of particular concern as it is considered a possible direct precursor of an extended-spectrum β-lactamase (ESBL).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,301
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Global Antimicrobial ResistanceMême sujetReproductive tract infections researchTravaux en français237 207