Functional Polymorphism in the NFE2L2 Gene Associated With Tuberculosis Susceptibility
Notice bibliographique
Résumé
Background Nuclear transcription factor erythroid 2 p45-related factor 2 (Nrf2), encoded by NFE2L2, functions as a key transcription factor and regulates expression of antioxidant genes. Our study aimed to investigate the association of single nucleotide polymorphisms of NFE2L2 with tuberculosis (TB) and latent tuberculosis infection (LTBI) and the underlying causal mechanisms. Methods 1950 unrelated Chinese Han participants were included in our two independent study groups. Five tag polymorphisms were selected and genotyped. The functional effects of the rs13005431 polymorphism were confirmed by dual-luciferase reporter assays and mRNA level comparisons. Results Rs13005431_C and rs2364723_G were associated with increased TB susceptibility (P = 0.010 and P = 0.041) after adjustment for confounding factors. rs6726395_A was associated with increased risk of active TB (P=0.035) in a comparison with the LTBI group. The frequency of haplotype rs1049751- rs13005431 AC was higher in the TB group (P =0.013), while frequency of haplotype AT was higher in the healthy control group (P =0.025). The luciferase activity of a plasmid with the rs13005431C-promoter was significantly lower than that of the rs13005431T-promoter. In addition, neutrophils with the CC/TC genotypes which were activated by GM-CSF showed a decreased level of NFE2L2 mRNA when compared with the rs13005431 TT genotype. Conclusions Our study suggests that allele C of rs13005431 might increase the susceptibility to TB by down-regulating the transcriptional activity of NFE2L2.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».