Dating Alphaproteobacteria evolution with eukaryotic fossils
Notice bibliographique
Résumé
Elucidating the timescale of the evolution of Alphaproteobacteria, one of the most prevalent microbial lineages in marine and terrestrial ecosystems, is key to testing hypotheses on their co-evolution with eukaryotic hosts and Earth's systems, which, however, is largely limited by the scarcity of bacterial fossils. Here, we incorporate eukaryotic fossils to date the divergence times of Alphaproteobacteria, based on the mitochondrial endosymbiosis that mitochondria evolved from an alphaproteobacterial lineage. We estimate that Alphaproteobacteria arose ~1900 million years (Ma) ago, followed by rapid divergence of their major clades. We show that the origin of Rickettsiales, an order of obligate intracellular bacteria whose hosts are mostly animals, predates the emergence of animals for ~700 Ma but coincides with that of eukaryotes. This, together with reconstruction of ancestral hosts, strongly suggests that early Rickettsiales lineages had established previously underappreciated interactions with unicellular eukaryotes. Moreover, the mitochondria-based approach displays higher robustness to uncertainties in calibrations compared with the traditional strategy using cyanobacterial fossils. Further, our analyses imply the potential of dating the (bacterial) tree of life based on endosymbiosis events, and suggest that previous applications using divergence times of the modern hosts of symbiotic bacteria to date bacterial evolution might need to be revisited.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».